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INDICE
Riassunto ... 4
1.Introduzione ... 6
1.1. Classificazione dei micobatteri ... 7
1.2. Morfologia, struttura e biochimica di Mycobacterium tuberculosis ... 9
1.3. Patogenesi ... 11
1.4. Epidemiologia ... 13
1.5. Terapia e farmaco- resistenza ... 15
1.5.1. Resistenza alla rifampicina ... 17
1.6. Prevenzione ... 18
2. Diagnosi convenzionale di TB ... 20
2.1. Raccolta dei campioni ... 20
2.2.Esame microscopico diretto ... 21
2.3 Isolamento colturale ... 25
2.4 Trattamento dei campioni ... 26
2.5. I terreni di coltura... 28
2.6. Identificazione... 31
2.7. Sensibilità ai farmaci... 34
2.8. Sicurezza nel laboratorio di micobatteriologia ... 36
3. Diagnosi molecolare rapida di TB ... 38
3.1. Rilevamento di MTB da campioni clinici mediante amplificazione genica ... 38
3.2. Il sistema GeneXpert... 39
4. Scopo della tesi ... 44
5. Materiali e Metodi... 45
5.1. Campioni ... 45
5.2. Trattamento dei campioni clinici ... 45
5.3. Esame batterioscopico... 46
5.4. Isolamento colturale ... 46
5.5. Identificazione degli isolati ... 47
5.6. Test fenotipico di suscettibilità alla rifampicina ... 48
5.7. Trattamento dei campioni inclusi in paraffina ... 48
5.8. Analisi mediante BDProbeTecET dei campioni paraffinati ... 49
5.9. Analisi GeneXpert... 49
6. Risultati e discussione ... 52
6.1. Valutazione del sistema GeneXpert per la rilevazione di MTB nei campioni clinici... 52
6.2. Valutazione semiquantitativa del GeneXpert ... 55
6.3. Valutazione del sistema GeneXpert per la rilevazione della resistenza alla rifampicina ... 56
6.4. Valutazione del sistema GeneXpert per la rilevazione di MTB in campioni inclusi in paraffina ... 57
3 7.Conclusioni ... 58 8. Bibliografia ... 59 Ringraziamenti ... 64
