SETTIMANA 01 24-02-2014 25-02-2014 26-02-2014 27-02-2014 28-02-2014
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09-10 05-S:Introduzione al seq. Solanacee 18-S:Introduzione al seq. Drupacee
10-11 INTRODUZIONE GIORNATEGENOMICHE 06-S: Sequenziamento Solanacee 09-S: Sequenziamento Pomacee 12-S: Sequenziamento vite 19-S: Sequenziamento Drupacee 11-12 01-S:Sequenziamento Graminacee 07-S: Sequenziamento Solanacee 10-S: Sequenziamento Pomacee 13-S: Sequenziamento vite 20-S: Sequenziamento Drupacee 12-13 02-S:Sequenziamento Graminacee 08-S: Sequenziamento Solanacee 11-S: Sequenziamento Pomacee 14-S: Sequenziamento vite 21-S: Sequenziamento Drupacee
13-14 22-Conclusioni sul seq. genomi veg,
14-15 03-S:Sequenziamento Graminacee 15- S: Sequenziamento olivo
15-16 04-S:Sequenziamento Graminacee 16- S: Sequenziamento olivo
16-17 17- S: Sequenziamento olivo
SETTIMANA 02 3-03-2014 4-03-2014 5-03-2014 6-03-2014 7-03-2014
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09-10
10-11 VACANZE CARNEVALE VACANZE CARNEVALE VACANZE CARNEVALE 01-Introduzione NGS 07-Introduzione NGS
11-12 02-Introduzione NGS 08-Introduzione NGS 12-13 03-Introduzione NGS 09-Introduzione NGS 13-14 14-15 04-Introduzione NGS 10-Introduzione NGS 15-16 05-Introduzione NGS 11-Introduzione NGS 16-17 06-Introduzione NGS 12-Introduzione NGS SETTIMANA 03 10-03-2014 11-03-2014 12-03-2014 13-03-2014 14-03-2014
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09-10
10-11 01-Genome Sequencer Illumina 07-Genome Sequencer Illumina 01-Tecnologie SOLID 07-Tecnologie SOLID 11-12 02-Genome Sequencer Illumina 08-Genome Sequencer Illumina 02-Tecnologie SOLID 08-Tecnologie SOLID 12-13 03-Genome Sequencer Illumina 09-Genome Sequencer Illumina 03-Tecnologie SOLID 09-Tecnologie SOLID 13-14
14-15 04-Genome Sequencer Illumina 10-Genome Sequencer Illumina 04-Tecnologie SOLID 10-Tecnologie SOLID 15-16 05-Genome Sequencer Illumina 11-Genome Sequencer Illumina 05-Tecnologie SOLID 11-Tecnologie SOLID 16-17 06-Genome Sequencer Illumina 12-Genome Sequencer Illumina 06-Tecnologie SOLID 12-Tecnologie SOLID
SETTIMANA 04 17-03-2014 18-03-2014 19-03-2014 20-03-2014 21-03-2014
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09-10
10-11 01-Consultaz. ed uso seq. genom. ann. 04-Consultaz. ed uso seq. genom. ann. 07-Consultaz. ed uso seq. genom. ann. 10-Consultaz. ed uso seq. genom. ann. 13-Consultaz. ed uso seq. genom. ann. 11-12 02-Consultaz. ed uso seq. genom. ann. 05-Consultaz. ed uso seq. genom. ann. 08-Consultaz. ed uso seq. genom. ann. 11-Consultaz. ed uso seq. genom. ann. 14-Consultaz. ed uso seq. genom. ann. 12-13 03-Consultaz. ed uso seq. genom. ann. 06-Consultaz. ed uso seq. genom. ann. 09-Consultaz. ed uso seq. genom. ann. 12-Consultaz. ed uso seq. genom. ann.
13-14
14-15 01-Fondamenti assemblaggio seq, 04-Fondamenti assemblaggio seq, 07-Fondamenti assemblaggio seq, 10-Fondamenti assemblaggio seq, 15-16 02-Fondamenti assemblaggio seq, 05-Fondamenti assemblaggio seq, 08-Fondamenti assemblaggio seq, 11-Fondamenti assemblaggio seq, 16-17 03-Fondamenti assemblaggio seq, 06-Fondamenti assemblaggio seq, 09-Fondamenti assemblaggio seq, 12-Fondamenti assemblaggio seq,
SETTIMANA 05 24-03-2014 25-03-2014 26-03-2014 27-03-2014 28-03-2014
09-10
10-11 01-Genomica comparativa 07-Genomica comparativa 13-Genomica comparativa 01-Genome Sequencer 454/Roche
11-12 02-Genomica comparativa 08-Genomica comparativa 14-Genomica comparativa 02-Genome Sequencer 454/Roche
12-13 03-Genomica comparativa 09-Genomica comparativa 15-Genomica comparativa 03-Genome Sequencer 454/Roche
13-14
14-15 04-Genomica comparativa 10-Genomica comparativa 16-Genomica comparativa 04-Genome Sequencer 454/Roche
15-16 05-Genomica comparativa 11-Genomica comparativa 17-Genomica comparativa 05-Genome Sequencer 454/Roche
16-17 06-Genomica comparativa 12-Genomica comparativa 18-Genomica comparativa 06-Genome Sequencer 454/Roche
SETTIMANA 06 31-03-2014 1-04-2014 2-04-2014 3-04-2014 4-04-2014
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09-10 31-Genomica comparativa 34-Genomica comparativa
10-11 19-Genomica comparativa 25-Genomica comparativa 32-Genomica comparativa 35-Genomica comparativa
11-12 20-Genomica comparativa 26-Genomica comparativa 33-Genomica comparativa 36-Genomica comparativa
12-13 21-Genomica comparativa 27-Genomica comparativa
13-14 01-Fondamenti mappaggio reads 05-Fondamenti mappaggio reads
14-15 22-Genomica comparativa 28-Genomica comparativa 02-Fondamenti mappaggio reads 06-Fondamenti mappaggio reads 15-16 23-Genomica comparativa 29-Genomica comparativa 03-Fondamenti mappaggio reads 07-Fondamenti mappaggio reads 16-17 24-Genomica comparativa 30-Genomica comparativa 04-Fondamenti mappaggio reads 08-Fondamenti mappaggio reads
SETTIMANA 07 7-04-2014 8-04-2014 9-04-2014 10-04-2014 11-04-2014
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09-10
10-11 01-Annotazione sequenze 11-Annotazione sequenze
11-12 02-Annotazione sequenze 12-Annotazione sequenze
12-13 03-Annotazione sequenze 13-Annotazione sequenze
13-14 09-Fondamenti mappaggio reads 12-Fondamenti mappaggio reads 07-Annotazione sequenze 14-Annotazione sequenze
14-15 10-Fondamenti mappaggio reads 13-Fondamenti mappaggio reads 04-Annotazione sequenze 08-Annotazione sequenze 15-16 11-Fondamenti mappaggio reads 14-Fondamenti mappaggio reads 05-Annotazione sequenze 09-Annotazione sequenze
16-17 06-Annotazione sequenze 10-Annotazione sequenze
SETTIMANA 08 14-04-2014 15-04-2014 16-04-2014 17-04-2014 18-04-2014
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09-10 INIZIO VACANZE PASQUA
10-11 01-RNA-Seq 11-12 02-RNA-Seq 12-13 03-RNA-Seq 13-14 14-15 04-RNA-Seq 15-16 05-RNA-Seq 16-17 06-RNA-Seq SETTIMANA 09 21-04-2014 22-04-2014 23-04-2014 24-04-2014 25-04-2014
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09-10 FINE VACANZE PASQUA
11-12 12-13 13-14 14-15 15-16 16-17 SETTIMANA 10 28-04-2014 29-04-2014 30-04-2014 1-05-2014 2-05-2014
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09-10 FESTA DEL LAVORO
10-11 01-Impiego microarray 04-Impiego microarray 07-Impiego microarray
11-12 02-Impiego microarray 05-Impiego microarray 08-Impiego microarray
12-13 03-Impiego microarray 06-Impiego microarray 09-Impiego microarray
13-14
14-15 07-RNA-Seq 10-RNA-Seq 13-RNA-Seq
15-16 08-RNA-Seq 11-RNA-Seq 14-RNA-Seq
16-17 09-RNA-Seq 12-RNA-Seq 15-RNA-Seq
SETTIMANA 11 5-05-2014 6-05-2014 7-05-2014 8-05-2014 9-05-2014
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09-10
10-11 10-Impiego microarray 13-Impiego microarray 16-Impiego microarray 19-Impiego microarray 22-Impiego microarray
11-12 11-Impiego microarray 14-Impiego microarray 17-Impiego microarray 20-Impiego microarray 23-Impiego microarray
12-13 12-Impiego microarray 15-Impiego microarray 18-Impiego microarray 21-Impiego microarray 24-Impiego microarray
13-14
14-15 16-RNA-Seq 19-RNA-Seq 22-RNA-Seq 25-RNA-Seq 28-RNA-Seq
15-16 17-RNA-Seq 20-RNA-Seq 23-RNA-Seq 26-RNA-Seq 29-RNA-Seq
16-17 18-RNA-Seq 21-RNA-Seq 24-RNA-Seq 27-RNA-Seq 30-RNA-Seq
SETTIMANA 12 12-05-2014 13-05-2014 14-05-2014 15-05-2014 16-05-2014
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09-10
10-11 46-RNA-Seq
11-12 47-RNA-Seq
12-13 48-RNA-Seq
13-14 31-RNA-Seq 35-RNA-Seq 39-RNA-Seq
14-15 32-RNA-Seq 36-RNA-Seq 40-RNA-Seq 43-RNA-Seq
15-16 33-RNA-Seq 37-RNA-Seq 41-RNA-Seq 44-RNA-Seq
16-17 34-RNA-Seq 38-RNA-Seq 42-RNA-Seq 45-RNA-Seq
SETTIMANA 13 19-05-2014 20-05-2014 21-05-2014 22-05-2014 23-05-2014
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09-10 01-Sequenziamento NGS si sRNA 08-Sequenziamento NGS si sRNA
10-11 02-Sequenziamento NGS si sRNA 09-Sequenziamento NGS si sRNA 15-Sequenziamento NGS si sRNA 11-12 03-Sequenziamento NGS si sRNA 10-Sequenziamento NGS si sRNA 16-Sequenziamento NGS si sRNA 12-13 04-Sequenziamento NGS si sRNA 11-Sequenziamento NGS si sRNA 17-Sequenziamento NGS si sRNA
13-14
14-15 05-Sequenziamento NGS si sRNA 12-Sequenziamento NGS si sRNA 18-Sequenziamento NGS si sRNA 15-16 06-Sequenziamento NGS si sRNA 13-Sequenziamento NGS si sRNA 19-Sequenziamento NGS si sRNA 16-17 07-Sequenziamento NGS si sRNA 14-Sequenziamento NGS si sRNA 20-Sequenziamento NGS si sRNA
SETTIMANA 14 26-05-2014 27-05-2014 28-05-2014 29-05-2014 30-05-2014
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09-10
10-11 01-ChiP-Seq per regol. trascriz. 07-ChiP-Seq per regol. trascriz. 13-ChiP-Seq per regol. trascriz. 18-ChiP-Seq per regol. trascriz. 11-12 02-ChiP-Seq per regol. trascriz. 08-ChiP-Seq per regol. trascriz. 14-ChiP-Seq per regol. trascriz. 19-ChiP-Seq per regol. trascriz. 12-13 03-ChiP-Seq per regol. trascriz. 09-ChiP-Seq per regol. trascriz. 15-ChiP-Seq per regol. trascriz. 20-ChiP-Seq per regol. trascriz. 13-14
14-15 04-ChiP-Seq per regol. trascriz. 10-ChiP-Seq per regol. trascriz. 16-ChiP-Seq per regol. trascriz. 15-16 05-ChiP-Seq per regol. trascriz. 11-ChiP-Seq per regol. trascriz. 17-ChiP-Seq per regol. trascriz. 16-17 06-ChiP-Seq per regol. trascriz. 12-ChiP-Seq per regol. trascriz.
SETTIMANA 15 2-06-2014 3-06-2014 4-06-2014 5-06-2014 6-06-2014
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09-10 FESTA DELLA REPUBBLICA
10-11 01-Risequenziamento genomi 05-Risequenziamento genomi 09-Risequenziamento genomi 13-Risequenziamento genomi
11-12 02-Risequenziamento genomi 06-Risequenziamento genomi 10-Risequenziamento genomi 14-Risequenziamento genomi
12-13 03-Risequenziamento genomi 07-Risequenziamento genomi 11-Risequenziamento genomi 15-Risequenziamento genomi
13-14 04-Risequenziamento genomi 08-Risequenziamento genomi 12-Risequenziamento genomi 16-Risequenziamento genomi
14-15 15-16 16-17
SETTIMANA 16 9-06-2014 10-06-2014 11-06-2014 12-06-2014 13-06-2014
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09-10
10-11 01-Ricerca polimorfismi 07-Ricerca polimorfismi 13-Ricerca polimorfismi 19-Ricerca polimorfismi 25-Ricerca polimorfismi
11-12 02-Ricerca polimorfismi 08-Ricerca polimorfismi 14-Ricerca polimorfismi 20-Ricerca polimorfismi 26-Ricerca polimorfismi
12-13 03-Ricerca polimorfismi 09-Ricerca polimorfismi 15-Ricerca polimorfismi 21-Ricerca polimorfismi 27-Ricerca polimorfismi
13-14 28-Ricerca polimorfismi
14-15 04-Ricerca polimorfismi 10-Ricerca polimorfismi 16-Ricerca polimorfismi 22-Ricerca polimorfismi
15-16 05-Ricerca polimorfismi 11-Ricerca polimorfismi 17-Ricerca polimorfismi 23-Ricerca polimorfismi
16-17 06-Ricerca polimorfismi 12-Ricerca polimorfismi 18-Ricerca polimorfismi 24-Ricerca polimorfismi
SETTIMANA 17 16-06-2014 17-06-2014 18-06-2014 19-06-2014 20-06-2014
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09-10 10-11 11-12
12-13 01-Sequenziamento genoma organelli 05-Sequenziamento genoma organelli 09-Sequenziamento genoma organelli 13-Sequenziamento genoma organelli 13-14 02-Sequenziamento genoma organelli 06-Sequenziamento genoma organelli 10-Sequenziamento genoma organelli 14-Sequenziamento genoma organelli 14-15 03-Sequenziamento genoma organelli 07-Sequenziamento genoma organelli 11-Sequenziamento genoma organelli 15-Sequenziamento genoma organelli
15-16 04-Sequenziamento genoma organelli 08-Sequenziamento genoma organelli 12-Sequenziamento genoma organelli 16-Sequenziamento genoma organelli 16-17
SETTIMANA 18 23-06-2014 24-06-2014 25-06-2014 26-06-2014
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09-10
10-11 17-Sequenziamento genoma organelli 01-Proteogenomica 01-Bioinf. in post-genomica 11-12 18-Sequenziamento genoma organelli 02-Proteogenomica 02 Bioinf. in post-genomica 12-13 19-Sequenziamento genoma organelli 03-Proteogenomica 03-Bioinf. in post-genomica 13-14 20-Sequenziamento genoma organelli
14-15 04-Proteogenomica
15-16 05-Proteogenomica
16-17 06-Proteogenomica
SETTIMANA 19 30-06-2014 1-07-2014 2-07-2014 3-07-2014 4-07-2014
LUN MAR MER GIO VEN
09-10
10-11 04-Bioinf. in post-genomica 07-Bioinf. in post-genomica 10-Bioinf. in post-genomica 16-Proteogenomica 11-12 05-Bioinf. in post-genomica 08-Bioinf. in post-genomica 11-Bioinf. in post-genomica 17-Proteogenomica 12-13 06-Bioinf. in post-genomica 09-Bioinf. in post-genomica 12-Bioinf. in post-genomica 18-Proteogenomica 13-14
14-15 07-Proteogenomica 10-Proteogenomica 13-Proteogenomica 19-Proteogenomica
15-16 08-Proteogenomica 11-Proteogenomica 14-Proteogenomica 20-Proteogenomica
16-17 09-Proteogenomica 12-Proteogenomica 15-Proteogenomica
SETTIMANA 20 7-07-2014 8-07-2014 9-07-2014 10-07-2014 11-07-2014
LUN MAR MER GIO VEN
09-10
10-11 13-Bioinf. in post-genomica 19-Bioinf. in post-genomica 25-Bioinf. in post-genomica 11-12 14-Bioinf. in post-genomica 20-Bioinf. in post-genomica 26-Bioinf. in post-genomica 12-13 15-Bioinf. in post-genomica 21-Bioinf. in post-genomica 27-Bioinf. in post-genomica 13-14
14-15 16-Bioinf. in post-genomica 22-Bioinf. in post-genomica 28-Bioinf. in post-genomica 15-16 17-Bioinf. in post-genomica 23-Bioinf. in post-genomica 29-Bioinf. in post-genomica 16-17 18-Bioinf. in post-genomica 24-Bioinf. in post-genomica 30-Bioinf. in post-genomica
SETTIMANA 21 14-07-2014 15-07-2014 16-07-2014 17-07-2014 18-07-2014
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09-10
10-11 31-Bioinf. in post-genomica 37-Bioinf. in post-genomica 01-S01:Prosp. genom. post-genom 07-S03:Prosp. genom. post-genom 11-12 32-Bioinf. in post-genomica 38-Bioinf. in post-genomica 02-S01:Prosp. genom. post-genom 08-S03:Prosp. genom. post-genom 12-13 33-Bioinf. in post-genomica 39-Bioinf. in post-genomica 03-S01:Prosp. genom. post-genom 09-S03:Prosp. genom. post-genom
13-14 04-S02:Prosp. genom. post-genom 10-S04:Prosp. genom. post-genom
14-15 34-Bioinf. in post-genomica
15-16 35-Bioinf. in post-genomica 05-S02:Prosp. genom. post-genom 11-S04:Prosp. genom. post-genom
B.01.a Overview sui progetti di sequenziamento
delle piante d'interesse agrario: (a) cereali ORE 21
B.09 Consultazione ed utilizzo di sequenze
genomiche annotate Traini Alessandra
B.01.b Overview sui progetti di sequenziamento delle piante d'interesse agrario: (b) solanacee
6 seminari da 3 ore ciascuno + 3 ore "miste": Luigi Cattivelli (graminacee), Giovanni Giuliano
(solanacee), Riccardo Velasco (pomacee), Massimo Delledonne (vite), Simone Scalabrin
(olivo), Ignazio Verde (drupacee).
B.10, Genomica comparativa: analisi di famiglie
geniche Sanseverino Walter
B.01.c Overview sui progetti di sequenziamento delle piante d'interesse agrario: (d) pomacee
B.11 RNA-Seq: Assemblaggio ed annotazione de novo di trascrittomi e digital gene expression profiling
D'Agostino Nunzio
B.01.d Overview sui progetti di sequenziamento delle piante d'interesse agrario: (e) drupacee
B.12 Impiego dei microarray per lo studio dell'
espressione genica Ferrarini Alberto
B.01.e Overview sui progetti di sequenziamento delle piante d'interesse agrario: (f) agrumi
B.13 Sequenziamento NGS di small RNA ed analisi
dei dati Faccioli Primetta
B.01.f Overview sui progetti di sequenziamento delle piante d'interesse agrario: (c) vite
B.14 ChiP-Seq applicato allo studio della
regolazione della trascrizione Matarazzo Maria Rosaria B.01.g Overview sui progetti di sequenziamento
delle piante d'interesse agrario: (f) olivo
B.15 Risequenziamento di genomi e risequenziamento targeted di geni candidati mediante tecnologie NGS
Delledonne Massimo B.02.a Introduzione agli approcci NGS: basi
teoriche e risultati attuali, le innovazioni e le prospettive
ORE 12 + 6
B.03 Genome Sequencer 454/Roche Gaetano Perrotta
B.04 Genome Sequencer Illumina ORE 12 Angela Cordella
B.05 Tecnologia SOLiD ORE 12 Giovanna Marchese Scotti Nunzia
B.06 Fondamentali sull'assemblaggio delle sequenze B.18 Proteogenomica Caterino Marianna
B.07 Fondamentali sul mappaggio delle reads lungo un genoma di riferimento
B.19 La bioinformatica nell'era post-genomica: strumenti e banche l'analisi e l' integrazione di dati 'omici'
Boccia Angelo D'Agostino Nunzio
B.17 Sequenziamento mediante tecnologie NGS ed annotazione del DNA mitocondriale e plastidico B.16. Ricerca di polimorfismi (SNPs/indels) da dati
B.08 Annotazione di sequenze genomiche: dalla sequenza alla funzione
B.20.a Prospettive della genomica e postgenomica nella genetica agraria
