SCOPO DELLA TESI
Data la conservazione funzionale e la conservazione evolutiva di proteine HMGA in molti metazoi, abbiamo deciso di rintracciare in banche dati le sequenze di proteine HMGA, allo scopo di realizzare uno studio delle loro relazioni filetiche. Sulla base delle sequenze scaricate dai database, abbiamo allestito allineamenti amminoacidici e nucleotidici per delineare al meglio le relazioni che intercorrono tra le varie sequenze HMGA di varie specie di cordati. Per fare ciò ci siamo avvalsi di software informatici atti a perfezionare l'allineamento multi-sequenza e a costituire alberi filogenetici sulla base di vari metodi e programmi disponibili.
Inoltre, per comprendere al meglio la caratterizzazione delle sequenze HMGA, quindi descrivere le differenze che intercorrono tra le sequenze denominate HMGA1, HMGA2 e genericamente HMGA, ho effettuato uno studio sull'allineamento amminoacidico, per individuare residui e motivi peculiari. Il fine ultimo è quello di descrivere elementi diagnostici, che aiutino a discriminare ad esempio le HMGA1da HMGA2 e dalle altre HMGA.
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