INDICE
RIASSUNTO
11. INTRODUZIONE
31.1. Il genere Paracentrotus Mortensen, 1903 3
1.2. Biologia ed ecologia di Paracentrotus lividus Lam., 1816 4
1.3. La variabilità genetica all’interno delle specie 8
1.4. Il flusso genico 10
1.5. La fitogeografia 11
1.6. Cenni sull’analisi dei dati filogeografici 12
1.7. Il DNA mitocondriale (mtDNA) 17
1.8. Caratteristiche genetiche di Paracentrotus lividus 21
1.9. Cenni sulla pesca di Paracentrotus lividus 22
2. MATERIALI E METODI
242.1. Siti di campionamento e trattamento dei campioni 24
2.2. Estrazione del DNA 26
2.2.1. Protocollo A 27
2.2.2. Protocollo B 28
2.3. Sintesi di oligonucleotidi 29
2.4. Reazioni di amplificazione e sequenziamento 29
2.5. Trattamento dei dati 30
2.5.1. Allineamento delle sequenze 30
2.5.2. Stime di diversità genetica all’interno dei campioni 30
2.5.3. Stime di diversità genetica tra campioni 31
2.5.4. Aspetti di demografia storica 33
3. RISULTATI
373.1. Diversità genetica all’interno dei campioni 37
3.2. Diversità genetica tra i campioni 38
3.2.1 F-Statistica 38
3.2.2 Analisi della varianza molecolare (AMOVA) 40
3.2.3 Network 41
3.2.4 Multidimensional scaling (MDS) 44
3.2.5 Stime di flusso genico 47
3.2.6 Test di Mantel 48
3.3 Aspetti di demografia storica 50
4. DISCUSSIONE
544.1. Diversità genetica all’interno dei campioni 54
4.2. Struttura genetica 54
4.3. Aspetti di demografia storica 58
4.4. Gestione 63
