U.S. National Library of Medicine
“ la sede”
8600 Rockville Pike, Bethesda, MD 20894 USA
U.S. National Library of Medicine
“ il sito”
www.nlm.nih.gov
NLM - National library of Medicine
Fornisce accesso a:
1. Database bibliografici e fattuali
2. Cataloghi e liste della biblioteca e listini delle pubblicazioni dell’NLM
3. Risorse per la formazione alla ricerca sulle fonti informative per la biomedicina
4. Informazioni sintetiche (factsheets) su
prodotti e servizi della NLM
NLM - I database - 1
• Anatomia
– Visible Human Project
• Bioetica
– Bioethicsline
• Clinical trials
– ClinicalTrials.gov
• Database bibliografici di medicina
– Medline
– Oldmedline
– Premedline
NLM - I database - 2
• HIV/AIDS
– Aidsline – Aidstrials – Aidsdrugs
• Informazione per i pazienti
– MEDLINEplus
• Medicina dello spazio
– Spaceline
MEDLINE
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/
NLM - Il sito web
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prodotti e servizi della NLM
Caratteristiche di MEDLINE
• Tipo di documenti indicizzati: articoli di rivista (gli atti di congresso compaiono solo se pubblicati su riviste).
• Copertura geografica: circa il 50% degli articoli appartiene a riviste pubblicate negli Stati Uniti, il restante 50% a riviste pubblicate in 80 altri Paesi
• Copertura linguistica: il 78% degli
articoli indicizzati in MEDLINE è
scritto in lingua inglese, ma questa
percentuale sale all’89% per gli
articoli inseriti tra 2000 e 2003
• Lingua d’interrogazione: l’Inglese, anche per reperire riferimenti ad articoli pubblicati in lingue diverse (il titolo dell’articolo, in questi casi, è tradotto in Inglese)
• Presenza di abstract: Tutti i riassunti presenti sono in inglese, indipendentemente dalla lingua in cui è scritto l’articolo
• Frequenza di aggiornamento: Quotidiana; ogni giorno vengono aggiunti 1500 – 3500 nuovi record. Nel 2004, sono stati aggiunti 571.000 nuovi record
Caratteristiche di MEDLINE
Quali tipi di studio si trovano?
Tendenzialmente tutti quelli pubblicati sulle riviste:
• lettere che esprimono opinioni
• report di casi singoli o di più casi
• studi qualitativi
• sperimentazioni non controllate
• studi di eziologia, studi prospettici
• sperimentazioni precliniche e cliniche controllate: studi caso-controllo, sperimentazioni randomizzate
controllate, ecc.
• revisioni narrative e sistematiche
• linee guida
Caratteristiche di MEDLINE
14/11/10 12
Struttura di Medline
• Medline è un insieme di citazioni bibliografiche ottenute dalla recensione di riviste.
• Ogni citazione crea un record.
• Ogni record è suddiviso in campi che identificano e qualificano l’argomento.
• Ogni articolo è identificato da parole chiave (MeSH – Medical Subject Heading) contenute nel thesaurus.
• Ad ogni parola chiave possono essere abbinati dei
qualificatori (subheadings).
14/11/10 13
Struttura del DB Medline
Riferimenti e date
Titolo
Abstract
14/11/10 14
Struttura del DB Medline
Autori e indirizzo
Lingua
Rivista
Struttura di una citazione / 1
I record (le singole citazioni bibliografiche) sono organizzati in campi. Ecco i principali:
• autore (fino a 25 cognomi);
• titolo dell'articolo;
• descrittori di soggetto (sono detti MeSH, ovvero
"Medical Subject Headings") rappresentano l'argomento di ogni singolo articolo;
• abstract (riassunto);
• fonte bibliografica (titolo della rivista in forma abbreviata, anno, volume, fascicolo, pagine);
• ente di appartenenza e indirizzo del primo degli autori dell'articolo;
• lingua originale in cui l'articolo è stato pubblicato;
• tipo di pubblicazione (ad es. lettera, editoriale, rassegna).
Struttura di una citazione / 1
Punto di partenza: quesito in forma
“narrativa”:
Esempio di ricerca
I sedativi della tosse sono efficaci nei bambini?
La ricerca su PubMed
Trasformazione con P.I.C.O.
Patient bambini con tosse Children - Cough Intervention sedativi della tosse sedative
Comparison - -
Outcome riduzione della tosse -
Consigli per l’utilizzo di PubMed per l’EBN
Dove abbiamo sbagliato?
I descrittori di soggetto:
I MeSH
MESH è l'acronimo di Medical Subject Headings, ovvero intestazioni di soggetto per la medicina e servono ad identificare i termini più appropriati per la ricerca.
Attualmente sono 23000 e sono scelti da specialisti di ogni
area della biomedicina.
Gli articoli sono indicizzati utilizzando un thesaurus (vocabolario controllato) quindi:
• i termini sono in forma normalizzata (tutti i sinonimi sono ricondotti ad un unico termine accettato. Es: tumor, cancer, cancers… “Neoplasms”)
• i termini sono collegati con una rete di rinvii. In particolare:
• “vedi”: rinvio da voce non accettata a voce accettata: es.:
“cancer” vedi Neoplasms
• “Vedi anche”: per i termini, entrambi accettati, che hanno una relazione importante. es.: Surgery, operative vedi anche intraoperative complications operating rooms
• i termini sono disposti in una gerarchia “ad albero”, in cui i
“broader terms” (termini più generali) contengono i “narrower terms”, termini più ristretti)
I descrittori di soggetto:
I MeSH
Conoscere la struttura dei MeSH può essere molto utile per elaborare una ricerca efficace.
1. Le 15 categorie principali del MeSH
1. Anatomy [A] 8. Physical sciences [H]
2. Organisms [B] 9. Anthropology, education, sociology and social phenomena [I]
3. Diseases [C] 10. Technology and food and beverages [J]
4. Chemicals and Drugs [D] 11. Humanities [K]
5. Analytical, diagnostic and therapeutic techniques and
equipment [E] 12. Information science [L]
6. Psychiatry and psychology [F] 13. Persons [M]
7. Biological Sciences [G] 14. Health care [N]
15. Geographic locations [Z]
Il Database MeSH
Ogni citazione nella parte di PubMed che
riguarda MEDLINE è indicizzata con i termini del Medical
Subject Headings (o MeSH) che descrivono il soggetto
contenuto nell'articolo. Il MeSH Browser di PubMed
permette di ricercare gli articoli attraverso i termini
MeSH.
Il Database MeSH
I sedativi della tosse sono efficaci nei bambini?
Riproviamo …
Cerchiamo il termine MeSH corrispondente inserendo nel riquadro di ricerca del Database MeSH la parola Sedatives
Il Database MeSH
Analizzando i risultati possiamo dedurre che NON si tratta della parola che
ci interessa
Il termine corretto è antitussive agents; selezioniamolo e clicchiamo sul pulsante "ADD to search builder" dopo aver evidenziato "AND" dal menu
a tendina. Infine clicchiamo su "Search PubMed"
Ripetiamo l’operazione con cough e clicchiamo su "Search PubMed"
Cliccando su Avanced
arriviamo in questa pagina
Qui, cliccando su Add dei termini ricercati, possiamo costruire la
stringa di ricerca
Una piccola prova ..
Una collega mi pone il seguente quesito: il parto vaginale dopo un pregresso taglio cesareo, comporta dei rischi per la madre e per il nascituro ma, nello stesso tempo, ripetuti parti chirurgici implicano interventi progressivamente più complessi e impegnativi per la donna; tutto questo si traduce in un problema bioetico che il professionista deve affrontare per poter consigliare correttamente una gestante.
Decido di effettuare una ricerca ..
Scenario 1
Scenario 2
Scenario 3
Scenario 4
Una piccola prova ..
Molti professionisti che prescrivono liquidi per via endovenosa nei pazienti ospedalizzati non hanno mai ricevuto un’adeguata formazione specifica, nonostante sia una delle procedure più frequenti implicando decisioni complesse su volume, frequenza e tipologie ottimali di liquidi da somministrare. Benché una inappropriata somministrazione endovenosa di liquidi sia raramente indicata come causa di danni ai pazienti, sarebbe opportuno utilizzare LG standardizzate per gestire questa terapia nei pazienti ospedalizzati.
Decido di effettuare una ricerca ..
Scenario 1
Scenario 2
Scenario 3
Scenario 4
La ricerca e l’uso
della bibliografia nella pratica assistenziale
3° atto
Bologna 19 dicembre 2016
riassumendo …
Medline è un insieme di citazioni bibliografiche ottenute dalla recensione di riviste.
Ogni citazione crea un record.
Ogni record è suddiviso in campi che identificano e qualificano l’argomento.
Ogni articolo è identificato da parole chiave (MeSH – Medical Subject Heading) contenute nel thesaurus.
Ad ogni parola chiave possono essere abbinati dei
qualificatori (subheadings).
• Ogni articolo indicizzato riceve un certo numero di
descrittori MeSH che definiscono il suo intero contenuto semantico
• Alcune voci di soggetto hanno una particolare rilevanza (indicate, nei record bibliografici, con l'asterisco (*)).
• Queste voci si ricercano specificando come qualificatore [MAJR].
riassumendo …
Consigli per l’utilizzo di PubMed per l’EBN
• Come reperire studi dotati di buona evidenza per il clinico?
– Corretta formulazione del quesito clinico (P.I.C.O.)
• Individuazione dei termini di ricerca riguardanti il contenuto
• Ricerca per tipo di pubblicazione (“publication type”)
• Ricerca per metodologie epidemiologiche e statistiche impiegate nello studio
– Metodologia:
• Ricerche sia per MeSH sia per “textword”
• Possibile utilizzo filtri
E ancora …. terminologia per la ricerca su database informatizzati
• Textword: parole o frasi fornite dagli autori e immesse nel database come appaiono stampate nelle riviste.
• Index word: termini di indicizzazione, argomenti principali o parole chiave inclusi in un vocabolario sviluppato dai produttori del db.
• Parole troncate (con asterisco): per includere più desinenze.
• Operatori booleani: parole per combinare: AND,OR, NOT.
• Filtri: sistemi per ridurre l’ampiezza della ricerca ed
aumentare la specificità.
• I LIMITI sono relativi a:
– riferimenti in cui l’argomento è il focus principale del documento (es. in CINAHL/MEDLINE si possono scegliere dei subheadings).
– certi tipi di documento (es. solo report di ricerca).
– una sola tipologia di riviste (es. solo infermieristiche).
– una certa caratteristica del documento (es. solo gli articoli con l’abstract).
– uno specifico periodo di pubblicazione (es. solo dopo il 1999).
– una certa lingua (es. solo in italiano).
– una certa caratteristica dei partecipanti dello studio (es.
solo i neonati, solo maschi, solo esseri umani).
E ancora …. terminologia per la ricerca su
database informatizzati
Ricerca libera: i termini inseriti vengono cercati in tutti i campi.
Ricerca per Campi: al termine si fa seguire il tag corrispondente ai campi di interesse ([au]=autore, [ti]=titolo, [so]= titolo della rivista.
Ricerca per frase: racchiudendo due o più termini tra virgolette (“ “) o facendoli seguire dal tag *tw+
verranno cercati come frase.
Ricerca per Titolo di Rivista
Il “Journal database”: fornisce informazioni sui periodici indicizzati in PubMed (ISSN, abbreviazioni standard, link alla scheda catalografica della National Library of Medicine…).
Ricerca per Autore: cognome + iniziali (es.: Caniggia A.)
Troncamento = *
Operatori Booleani = AND, OR, NOT
Parentesi per stabilire un ordine di priorità per ricerche con più termini.
Limiti per campo, tipologia di pubblicazione (editoriale, lettera, metanalisi, linee guida, ecc.), età del gruppo di studio, data di pubblicazione, lingua, solo citazioni con abstract, uomo/animale, subset (AIDS, bioetica, tossicologia, ecc.) e sesso.
Single Citation Matcher: una maschera di ricerca con tutti i campi della citazione.
Serve per trovare rapidamente una citazione di cui si conoscano almeno alcuni elementi.
Ricerca per descrittore: i MeSH - Medical Subject Headings (ca 19.000 descrittori
principali, ca 800 subheadings, più di 100.000 voci supplementari)
Il
Mesh Database
Ogni termine è corredato da una definizione, dalla struttura gerarchica (termini sovraordinati e sottordinati), dalle qualificazioni; una volta scelto il termine è possibile inserirlo direttamente in una maschera di ricerca con l’operatore adeguato e ripetere la ricerca e la selezione di tutti i termini necessari: a questo punto è possibile lanciare la ricerca attraverso ilpulsante “search PubMed”.
Clinical Queries:
sono un particolare gruppo di filtri di
ricerca sviluppati per il reperimento di studi clinici di particolare rilievo per i medici che praticano la medicina basata sull’evidenza (EBM).
Funzioni avanzate:
Funzioni avanzate: Mappatura Automatica dei Termini
L’opzione Details permette di vedere come il programma ha interpretato la richiesta
Funzioni avanzate:
Index – permette di costruire stringhe di ricerca attraverso la consultazione dei vari indici.
Preview – visualizza il numero di record risultanti da una ricerca prima di
mostrare le citazioni, permettendo così di aggiustare la strategia.
Funzioni avanzate:
History – memorizza fino a 100 ricerche e consente di incrociare i set.
Funzioni avanzate:
Clipboard
– cartella per l’archiviazione dei record provenienti da varie ricerche, fino ad un massimo di 500.My NCBI
– Per salvare in modo permanente strategie di ricerca; permette l’invio di alert in posta elettronica qualora vi siano degli aggiornamenti. Richiede un’ iscrizione gratuita e si accedetramite password.
