Attività svolta durante il DOTTORATO DI RICERCA IN
FISIOPATOLO-GIA CLINICA
Research of genetic alterations in lung and thyroid cancer
Riassunto dell’attività svolta
Analisi di espressione di un centinaio di geni, con sistema Nanostring, di Agoaspirati tiroidei
con diagnosi istologica nota per la valutazione di una “signature” del tumore tiroideo.
Individuazione di un pannello di ipotetici marcatori e applicazione per la diagnosi di
campioni risultati indeterminati alla diagnosi citologica (TIR3). (Lavoro Scientifico
pubblicato
1)
Genotipizzazione di una serie consecutiva di Agoaspirati; analisi di espressione mediante
PCR Array di un pannello di geni codificanti per molecole della matrice extracellulare (ECM)
e di adesione (CAMs). Individuazione dei geni differenzialmente espressi e validazione
mediante real time RT-PCR e Immunoistochimica. (Lavoro Scientifico under review
4)
Analisi mutazionale (geni BRAF, H-N-KRAS, hTERT) di una serie consecutiva di Carcinomi
Papillari della Tiroide. (Lavoro scientifico in stesura)
Analisi mutazionale di hTERT e geni della famiglia RAS in una serie di Carcinomi Follicolari e
Adenomi della Tiroide. (Lavoro scientifico in stesura)
Genotipizzazione di una serie di carcinomi papillari variante follicolare e microcarcinomi
Papillari risultati negativi al test post intervento, di tiredoctomia totale o parziale, per la
valutazione della presenza di cellule neoplastiche, WBS (Whole Body Scan) e definiti “very
low risk” . Valutazione dello stato mutazione e dei parametri istologici e dell’outcome
clinico. (Lavoro scientifico in stesura)
Profilo di metilazione e genotipizzazione dei campioni analizzati per le principali lesioni
oncogeniche (RAS e PAX8/PPARG) di carcinomi follicolari e adenomi
Analisi Mutazionele di Carcinomi Poco Differenziati Tiroidei (Poor Differentiated
Carcinoma-PDC) con pattern architetturale di crescita diverse.
Analisi di espressione di un pannello di circa 800 microRNA, con sistema Nanostring, di un
gruppo di Carcinomi Papillari Variante Follicolare e Adenomi, risultati wild type a una
genotipizzazione estesa.
Analisi di espressione di microRNA, con sistema Nanostring, di un gruppo di tumori delle
ghiandole salivari, analizzati già con un approccio di proteomica.
Collaborazione con IRCCS IRST – Istituto Scientifico Romagnolo per la validazione del
Fluorescence Long DNA test; Raccolta di campioni, trattamento ed estrazione del DNA per
la valutazione della quantità e qualità del DNA delle cellule di esfoliazione della mucosa del
colon presenti nelle feci. (Acquisizione e analisi dei dati per stesura Lavoro Scientifico).
Analisi del profilo di espressione di miRNA per delineare il profilo molecolare di
“Noninvasive follicular thyroid neoplasm with papillary-like nuclear features” (NIFTP), la
nuova categoria borderline di tumore della tiroide, per classificare meglio questi tumori in
entità biologicamente e clinicamente rilevanti. Determinazione e confronto dei profili di
espressione di miRNAs e stato mutazionale di una serie di FVPTC capsulati, non capsulati e
adenomi.
Seminari
12.12.2014 Il percorso diagnostico e terapeutico del paziente affetto da Nsclc: innovazione
e sostenibilità”
13.05.2015 V Corso Nazionale AIOM e SIAPEC-IAP
15.05.2015 The Young Biomarkers Day – a SIF/AIOM Joint Symposium
Permanenza all’estero
- Gennaio 2016-Aprile 2017
Division of Molecular & Genomic Pathology , UPMC (University of Pittsburg), Prof. Yuri Nikiforov
Ampia analisi del genoma (Thyro-Seq, CytoScan) e trascrittoma ( RNA-Seq) in una serie di lesioni
tiroidee oncocitiche, per fornire nuovi marcatori utili per comprendere il comportamento di
que-sto insolito e relativamente raro tipo di tumore. Identificazione e convalida di nuovi potenziali
marcatori diagnostici e prognostici.
Lavori scientifici
1: Rago T, Scutari M, Loiacono V, Santini F, Tonacchera M, Torregrossa L, Giannini R, Borrelli N, Proietti A, Basolo F, Miccoli P, Piaggi P, Latrofa F, Vitti P. Low Elasticity of Thyroid Nodules on Ultrasound Elastography Is
Correlated with Malignancy, Degree of Fibrosis, and High Expression of Galectin-3 and Fibronectin-1. Thyroid. 2017 Jan;27(1):10Galectin-3-110. doi:
10.1089/thy.2016.0341.Epub 2016 Dec 21. PubMed PMID: 27809694.
2:Cacciato Insilla A , Proietti A , Borrelli N , Niccoli C, Vitti P, Miccoli P and Basolo F TERT promoter mutations and their correlation with BRAF and RAS mu-tations in a consecutive cohort of 145 thyroid cancers. Oncology Letters Spandi-dos.(
3: Ugolini C, Borrelli N, Niccoli C, Elisei R, Viola D, Vitti P, Miccoli P, Basolo F. Role of YAP-1 in Thyroid Tumor Progression and Outcome. Appl Immunohistochem Mol Morphol. 2016 Oct 7. [Epub ahead of print] PubMed PMID: 27753655.
4: Borrelli N, Denaro M, Ugolini C, Poma AM, Miccoli M, Vitti P, Miccoli P, Basolo F. miRNA expression profiling of 'noninvasive follicular thyroid neop-lasms
with papillary-like nuclear features' compared with adenomas and infiltrative follicular variants of papillary thyroid carcinomas. Mod Pathol. 2017
Jan;30(1):39-51. doi: 10.1038/modpathol.2016.157. Epub 2016 Sep 2. PubMed PMID: 27586203.
5: Giannini R, Lupi C, Sensi E, Alì G, Proietti A, Boldrini L, Servadio A, Giordano M, Macerola E, Bruno R, Borrelli N, Chella A, Melfi F, Lucchi M, Ribechini A, Vasile E, Cappuzzo F, Mussi A, Fontanini G. EGFR and KRAS mutatio-nal
analysis in a large series of Italian non-small cell lung cancer patients: 2,387 cases from a single center. Oncol Rep. 2016 Aug;36(2):1166-72. doi:
10.3892/or.2016.4874. Epub 2016 Jun 14. PubMed PMID: 27373829.
6: Borrelli N, Ugolini C, Giannini R, Antonelli A, Giordano M, Sensi E,
Torregrossa L, Fallahi P, Miccoli P, Basolo F. Role of gene expression profiling in defining indeterminate thyroid nodules in addition to BRAF analysis. Cancer Cytopathol. 2016 May;124(5):340-9. doi: 10.1002/cncy.21681. Epub 2016 Jan 7. PubMed PMID: 26749005.
7: Giannini R, Torregrossa L, Gottardi S, Fregoli L, Borrelli N, Savino M,
Macerola E, Vitti P, Miccoli P, Basolo F. Digital gene expression profiling of a series of cytologically indeterminate thyroid nodules. Cancer Cytopathol. 2015 Aug;123(8):461-70. doi: 10.1002/cncy.21564. Epub 2015 May 29. PubMed PMID:
26033834.
8: Schirripa M, Bergamo F, Cremolini C, Casagrande M, Lonardi S, Aprile G, Yang D, Marmorino F, Pasquini G, Sensi E, Lupi C, De Maglio G, Borrelli N, Pizzolitto S, Fasola G, Bertorelle R, Rugge M, Fontanini G, Zagonel V, Loupakis F, Falcone A. BRAF and RAS mutations as prognostic factors in metastatic colorectal cancer patients undergoing liver resection. Br J Cancer. 2015 Jun 9;112(12):1921-8. doi:
10.1038/bjc.2015.142. Epub 2015 May 5. PubMed PMID: 25942399; PubMed Central PMCID: PMC4580391.
9: Miccoli P, Torregrossa L, Borrelli N, Materazzi G, Cacciato Insilla A, Micco-li
M, Basolo F. E-selectin expression and BRAF status in papillary thyroid carcinomas: Correlation with clinicopathologic features. Surgery. 2014
Dec;156(6):1550-7; discussion 1557-8. doi: 10.1016/j.surg.2014.08.049. Epub 2014 Nov 11. PubMed PMID: 25456953.
10: Proietti A, Borrelli N, Giannini R, Romani R, Di Coscio G, Quilici F, Rago T,
Miccoli P, Vitti P, Basolo F. Molecular characterization of 54 cases of
false-negative fine-needle aspiration among 1347 papillary thyroid carcinomas. Cancer Cytopathol. 2014 Oct;122(10):751-9. doi: 10.1002/cncy.21454. Epub 2014 Jun
9. PubMed PMID: 24913568.
11: Alì G, Proietti A, Pelliccioni S, Niccoli C, Lupi C, Sensi E, Giannini R, Borrelli N, Menghi M, Chella A, Ribechini A, Cappuzzo F, Melfi F, Lucchi M, Mus-si
A, Fontanini G. ALK rearrangement in a large series of consecutive non-small cell
lung cancers: comparison between a new immunohistochemical approach and
fluorescence in situ hybridization for the screening of patients eligible for crizotinib treatment. Arch Pathol Lab Med. 2014 Nov;138(11):1449-58. doi: 10.5858/arpa.2013-0388-OA. Epub 2014 Jun 2. PubMed PMID: 24885803.
12: Alì G, Borrelli N, Riccardo G, Proietti A, Pelliccioni S, Niccoli C, Boldri-ni
L, Lucchi M, Mussi A, Fontanini G. Differential expression of extracellular matrix constituents and cell adhesion molecules between malignant pleural mesothelioma and mesothelial hyperplasia. J Thorac Oncol. 2013 Nov;8(11):1389-95.
doi: 10.1097/JTO.0b013e3182a59f45. PubMed PMID: 24084442.
13: Di Desidero T, Fioravanti A, Orlandi P, Canu B, Giannini R, Borrelli N, Man S, Xu P, Fontanini G, Basolo F, Kerbel RS, Francia G, Danesi R, Bocci G.
Antiproliferative and proapoptotic activity of sunitinib on endothelial and
anaplastic thyroid cancer cells via inhibition of Akt and ERK1/2 phosphorylation and by down-regulation of cyclin-D1. J Clin Endocrinol Metab. 2013
Sep;98(9):E1465-73. doi: 10.1210/jc.2013-1364. Epub 2013 Aug 22. PubMed PMID: 23969186.
14: Ugolini C, Elisei R, Proietti A, Pelliccioni S, Lupi C, Borrelli N, Viola D, Leocata P, Vitti P, Miccoli P, Toniolo A, Basolo F. FoxP3 expression in papil-lary
thyroid carcinoma: a possible resistance biomarker to iodine 131 treatment. Thyroid. 2014 Feb;24(2):339-46. doi: 10.1089/thy.2012.0589. Epub 2013 Sep 26. PubMed PMID: 23915122.
15: Borrelli N, Giannini R, Proietti A, Alì G, Pelliccioni S, Niccoli C, Lucchi M, Melfi F, Mussi A, Basolo F, Fontanini G. KIF5B/RET fusion gene analysis in a selected series of cytological specimens of EGFR, KRAS and EML4-ALK wild-type adenocarcinomas of the lung. Lung Cancer. 2013 Sep;81(3):377-81. doi:
10.1016/j.lungcan.2013.06.026. Epub 2013 Jul 25. PubMed PMID: 23891510.
16: Proietti A, Sartori C, Borrelli N, Giannini R, Materazzi G, Leocata P, Eli-sei
R, Vitti P, Miccoli P, Basolo F. Follicular-derived neoplasms: morphometric and genetic differences. J Endocrinol Invest. 2013 Dec;36(11):1055-61. doi:
10.3275/9063. Epub 2013 Jul 23. PubMed PMID: 23888303.
17: Alì G, Proietti A, Niccoli C, Pelliccioni S, Borrelli N, Giannini R, Lupi C, Valetto A, Bertini V, Lucchi M, Mussi A, Fontanini G. EML4-ALK translocation in both metachronous second primary lung sarcomatoid carcinoma and lung
adenocarcinoma: a case report. Lung Cancer. 2013 Aug;81(2):297-301. doi: 10.1016/j.lungcan.2013.03.016. Epub 2013 May 10. PubMed PMID: 23664446.
18: Torregrossa L, Giannini R, Borrelli N, Sensi E, Melillo RM, Leocata P, Materazzi G, Miccoli P, Santoro M, Basolo F. CXCR4 expression correlates with the
degree of tumor infiltration and BRAF status in papillary thyroid carcinomas. Mod
Pathol. 2012 Jan;25(1):46-55. doi: 10.1038/modpathol.2011.140. Epub 2011 Sep 9. PubMed PMID: 21909080.
