Session SMF 2019 – Lourdes
Réseau de mesures de la biodiversité des sols :
vers une surveillance de la fonge dans les sols français ?
Claudy Jolivet1, Lucia Santorufo1, Carole Ortega1, Camille Imbert1, Antonio Bispo1 1INRA Centre de Recherches Val de Loire – US 1106 INFOSOL
2163, Avenue de la pomme de pin – CS 40001 Ardon 45075 Orléans cedex 2
Tél : (+33) 02 38 41 48 24
claudy.jolivet@inra.fr
Le sol est un milieu vivant. L’abondance, la diversité et l’activité des organismes vivants que l’on y trouve (faune, fonge et flore) sont un des facteurs clés de sa qualité. Tous ces organismes et plus particulièrement les micro-organismes, bactéries et champignons, jouent un rôle primordial dans la formation des sols, leur fonctionnement et leur évolution.
Depuis le début des années 2000, le Réseau de mesures de la qualité des sols (RMQS) a pour objectif d’évaluer et de suivre à long terme la qualité des sols de France métropolitaine et ultramarine (http://www.gissol.fr/le-gis/programmes/rmqs-34). Du fait de son extension et sa représentativité nationale, le RMQS pourrait servir de support au développement d’un réseau de surveillance de la biodiversité du sol (faune, microflore, fonge) et en lien direct avec le sol (flore). Dans le cadre d’une convention passée avec l’Agence française pour la biodiversité, l’INRA est chargée de coordonner un projet visant à définir les caractéristiques de ce réseau : variables biologiques à mesurer et leurs protocoles, modalités d’acquisition des données et points à échantillonner, partenaires scientifiques et techniques pour l’acquisition des données, analyse et interprétation des variables, coûts et gouvernance. L’intégration de données mycologiques dans les réseaux de surveillance environnementaux, notamment ceux qui s’intéressent à la qualité des sols, est encore peu développée. En France, le travail précurseur mené sur les placettes du réseau RENECOFOR illustre l’intérêt d’associer des inventaires mycologiques systématiques aux réseaux de surveillance. Par ailleurs, le développement récent et rapide des outils moléculaires permettant de caractériser la richesse et la diversité des microorganismes du sol à partir d’une extraction d’ADN rend désormais possible une évaluation et un suivi de la fonge sur de grand échantillons. Dans le cadre du projet de réseau de surveillance de la biodiversité du sol, nous envisageons d’associer la réalisation d’inventaires classiques, basés sur la présence des sporophores qui donnent accès à des données phénologiques, avec des analyses moléculaires qui permettent des inventaires quasi exhaustifs. Ces indicateurs fongiques pourraient être confrontés aux données pédologiques et environnementales collectées sur le RMQS, ce qui ouvrirait la porte à de nombreuses applications environnementales, en lien avec le changement climatique, les menaces qui s’exercent sur les sols et les habitats et la biodiversité fongique. Les analyses moléculaires sont en cours de réalisation sur les 2200 sites échantillonnés lors de la première campagne du RMQS (2000-2009) et pourront être reconduites sur les échantillons de la deuxième campagne RMQS en cours (2016-2027). En revanche, la mise en œuvre des inventaires classiques nécessiterait de construire un réseau qui mobiliserait les structures associatives mycologiques à l’échelle du territoire français.
