EPIDEMIOLOGIA DELLE INFEZIONI FUNGINE E FARMACO RESISTENZA DI MICETI LIEVITIFORMI IN AMBITO NOSOCOMIALE

UNIVERSITÀ DI PISA

FACOLTÀ DI SCIENZE MATEMATICHE FISICHE E NATURALI

CORSO DI LAUREA IN SCIENZE BIOLOGICHE

TESI DI LAUREA

EPIDEMIOLOGIA DELLE INFEZIONI FUNGINE E

FARMACO RESISTENZA DI MICETI LIEVITIFORMI

IN AMBITO NOSOCOMIALE

Relatori

Chiar.mo Prof. Mario Campa

Dott. Piero Leonetti

Candidato

Sergio Costanzo

INDICE DELLE ILLUSTRAZIONI

Immagine 2 Pseudoifa di lievito Immagine 3 La riproduzione asessuata Immagine 4 Le strutture dei conidiofori Immagine 5 Clamidospore e Artrospore

Immagine 6 Strutture deputate alla produzione di spore Immagine 7 Conidiofori di A. niger

Immagine 8 Esame radiografico di paziente con Aspergillosi Immagine 9 Lesione polmone sin. da A. fumigatus

Immagine 10 Il terreno agar Sabouraud Immagine 11 Flaconi da emocoltura Immagine 12 Il sistema Bactec

Immagine 13 Fotorilevazione di Fluorescenza Immagine 14 Curva di crescita positiva

Immagine 15 Blastospore di Candida ssp al microscopio ottico Immagine 16 C. albicans (A), C. parapsilosis (B), C. krusei (C)

Immagine 17 Smart Carrier

Immagine 18 Smart Carrier e Card YST Immagine 19 Il sistema VITEK2

Immagine 20 La micropiastra YEAST ONE Immagine 21 La striscia E Test per Amfotericina Immagine 22 Alone di inibizione per Fluconazolo

ELENCO DELLE ABBREVIAZIONI

ISHAM International Society for Human and Animal Mycology CIOMS Council for International Organizations of Medical Sciences AIDS Sindrome da Immunodeficienza Acquisita

TOF Trapianto Ortotopico di Fegato ATS American Thoracic Society UFC Unità Formanti Colonie PAS Acido periodico di Shiff BHI Brain Hearth Infusion Broth OCCA Oxoid Chromogenic Candida Agar

U.O. Unità Operativa

CLSI Committee Clinical for Laboratoriy Standard International ATCC American Type Culture Collection

VEQ Centro Verifica Qualità Esterna CVC Catetere Venoso Centrale FC 5 Fluorocitosina

AB Amfotericina B

FZ Fluconazolo

IZ Itraconazolo

VOR Voriconazolo

CYP51 Citocromo P450 Sterol 14 alpha-demethylase r.p.m. Rivoluzioni per minuto

INDICE

RIASSUNTO ……… pag 1

1 INTRODUZIONE………. pag 3

1.1 Breve nota storica………. pag 3

1.2 I miceti di interesse clinico: struttura e replicazione ……… pag 4 1.3 La classificazione dei miceti……….……….. pag 8 1.4 Le micosi umane: nomenclatura………. pag 13 1.5 Le micosi umane: classificazione ………. pag 14 1.6 Le micosi umane: ecologia degli agenti eziologici…………. pag 25 1.7 Miceti di interesse clinico……….. pag 26 1.8 Prelievo di campioni clinici ………. pag 36

1.9 Trattamento dei campioni………. pag 38

1.10 Scopo della Tesi……… pag 43

2 MATERIALI E METODI……… pag 44

2.1 Allestimento delle colture……… pag 44

2.2 Analisi delle colture……… pag 47

2.3 Identificazione di miceti lievitiformi……… pag 49 2.4 Antimicogramma di miceti lievitiformi……….. pag 52

2.5 Le molecole antifungine………. pag 56

2.6 Controllo di qualità……… pag 57

3 RISULTATI……… pag 59

3.1 Recupero di dati statistici………. pag 59 3.2 Analisi dei dati statistici……….. pag 59 3.3 Monitoraggio di micosi sistemiche……… pag 64 3.4 Farmaco resistenza di miceti lievitiformi……… pag 68 3.5 Farmacoresistenza dei ceppi isolati dalle emocolture…… pag 70

3.6 Caspofungina……… pag 71

3.7 Isolamento di ifomiceti……….. pag 72

4 DISCUSSIONE……….. pag 75