CURRICULUM VITAE Chiari Marcella
Titoli Accademici
1990: Specializzazione in Biochimica Clinica (indirizzo analitico) Università degli Studi di Milano 1982: Laurea in Chimica e Tecnologia Farmaceutiche presso l' Università di Milano
1976: Diploma di maturità classica (Liceo Ginnasio Arnaldo, Brescia) Curriculum professionale
- dal 2016 ad oggi: dipendente di I° livello professionale , profilo Dirigente di Ricerca presso L’Istituto di Chimica del Riconoscimento Molecolare (ICRM), Consiglio Nazionale delle Ricerche (CNR) via Mario Bianco 9, 20131 Milano.
-1999-2016: dipendente di II° livello professionale, profilo Primo Ricercatore presso L’Istituto di Chimica del Riconoscimento Molecolare (Ex Istituto di Biocatalisi e Riconoscimento Molecolare) del C.N.R. di Milano
-1992-1996: ricercatore a tempo determinato (Ex articolo 36) dell'Istituto di Chimica degli Ormoni (CNR) Via Mario Bianco 9, 20131 Milano.
- 1990: borsa di studio del CNR presso Dipartimento di Scienze e Tecnologie Biomediche,
Università di Milano, laboratorio del Prof. Pier Giorgio Righetti, "Sintesi di Immobiline di seconda generazione" nell'ambito del progetto finalizzato Chimica Fine II
- 1987: borsa di studio del CNR presso Dipartimento di Scienze e Tecnologie Biomediche, Università di Milano, laboratorio del Prof. Pier Giorgio Righetti, " Sviluppo di una banca dati sui bioreattori enzimatici insolubilizzati".
- 1986: borsa di studio dall'Industria A. Menarini di Firenze dal titolo: "Sintesi di composti a struttura chinonica di potenziale attività antitumorale", Dipartimento di Chimica e Biochimica Medica della Facoltà di Medicina dell'Università degli Studi di Milano, laboratorio del prof. Enzo Santaniello.
Principali Attività di Ricerca
Sviluppo di tecnologia microarray. Nel contesto di questa attività sono stati affrontati sia gli aspetti chimici che quelli biologici e strumentali della tecnologia microarray. In particolare sono stati realizzati metodi per l’immobilizzazione di sonde biologiche su superfici mediante rivestimenti con polimeri funzionali. L’attività in questo campo ha condotto, tra l’altro, allo sviluppo di polimeri che permettono di formare rivestimenti molto efficienti in modo semplice e veloce per adsorbimento su diversi tipi di superfici. Il metodo di preparazione, che è stato brevettato in Europa (EP 1567 569B) e negli Stati Uniti (US 8,809,071, US 9,834,617), è stato oggetto di numerose pubblicazioni su prestigiose riviste JCR. Il metodo è stato utilizzato nell’ambito di tre progetti di ricerca della CE (NANOSPAD, TRACEBACK, NASPE) in cui l’unità CNR ha avuto come compito la realizzazione di rivestimenti polimerici su diversi tipi di sensori.
In parallelo all’attività di modifica delle superfici, la candidata ha affrontato la tematica dello sviluppo di microarray a DNA e proteine per specifiche applicazioni diagnostiche. Nel campo del DNA è stata sviluppata una tecnologia ultra sensibile per il rilevamento delle mutazioni di oncogeni mediante un analisi di biopsia liquida in pazienti affetti da cancro per una terapia personalizzata. I risultati della ricerca hanno condotto al deposito della domanda di brevetto:
Genotyping of Mutations by combination of in-tube hybridization and universal TAG-microarray”,
PCT/IB2018/052219 del 2018-03-30, inventori CNR Marcella Chiari, Damin Francesco, inventori San Raffaele Galbiati Silvia, Maurizio Ferrari, entrata nelle fasi nazionali nel 2019 in USA, Europe, China, India.
Nel campo dei microarray a proteine è stato sviluppato un dosaggio di immunoglobuline della classe E allergene specifiche. L’attività rivolta allo sviluppo della strumentazione per tecnologia microarray è nata nell’ambito della collaborazione con diversi gruppi di ingegneri elettronici. Con il gruppo del Prof. Sergio Cova del Politecnico di Milano si è realizzato, all’interno del progetto NANOSPAD un sistema innovativo per la rivelazione della fluorescenza di microarray basato su matrici di fotodiodi noti come SPAD (single photon avalanche diode). Con il gruppo del Prof.
Selim Unlu, Boston University è stato sviluppato un detector interferometrico per microarray. Il coordinamento di un prestigioso progetto FET-Open è uno dei risultati della collaborazione. Il progetto ha come obiettivo lo sviluppo di una piattaforma per la rilevazione di particelle extracellulari (EV) mediante la realizzazione di uno strumento prototipo che integra un modulo per la separazione di EV da fluidi biologici complessi con un sensore in grado di rivelare singole particelle mediante interferometria. Nell'ambito di questo progetto è stato sviluppato un metodo per la separazione di EV che ha dato luogo al deposito della domanda di brevetto italiano 102019000018239.
Sviluppo di Elettroforesi capillare. L’attività ha riguardato lo sviluppo di rivestimenti polimerici per colonne capillari e di matrici separative per elettroforesi di DNA e proteine, con particolare riguardo alla microchip elettroforesi. Alcuni degli articoli maggiormente citati della candidata riguardano la sintesi e caratterizzazione di numerosi nuovi polimeri quali specifici rivestimenti di colonne capillari per sopprimere il flusso elettrosmotico e l’interazione con le proteine.
Sviluppo di monomeri acrilammidici. Nel contesto dell’elettroforesi di DNA e proteine la candidata si è dedicata alla sintesi di nuovi monomeri acrilammidici dotati di elevata stabilità chimica ed idrofilia. Si sono sviluppati nuovi idrogeli con porosità intermedia tra quella dell’acrilammide dell’agarosio e nuove matrici setaccianti per elettroforesi capillare.
La candidata si è anche occupata degli aspetti chimici della tecnologia del’isoelettrofocalizzazione in gradienti di pH immobilizzati, maturando notevoli competenze in una delle tecnica separativa maggiormente utilizzate in proteomica. La candidata ha sintetizzato nuove molecole acrilammido derivate che hanno consentito di migliorare le prestazioni della tecnica.
Progetti Scientifici recenti:
1/03/2019- ad oggi: contratto con Società Ador Diagnostics (Cipro)
1/06/2019 ad oggi: contratto di un anno con società Lucidant Polymers Inc. (Sunnivale California USA)
1/11/2016 - ad oggi: INDEX, Integrated nanoparticle isolation and detection system for complete on-chip analysis of exosomes, EU, H2020-FETOPEN-2016-2017. Coordinatore di progetto
2014 : CL.AN Cluster Agroalimentare Nazionale SAFE&SMART – New enabling technologies for food safety and security.
2013-2015: MINER, Analysis of Biofluid Microvesicles by interferometric Reflectance Imaging sensor, Cariplo & Regione Lombardia POR-FESR.
1/01/2010-30/09/2013, Progetto Seed IPG-CHIP, Istituto Italiano di Tecnologia.
6/8/2010 – 2013, Progetto SEPSIS, Bando Regione Lombardia per interventi di ricerca industriale e sviluppo sperimentale nelle aree tematiche prioritarie. Programma operativo regionale 2007-2013.
06/07/2010 - 05/01/2012, FREE IMAGER (RIF. SAL 39), Regione Lombardia Bando di invito a presentare progetti di Cooperazione Scientifica e Tecnologica Internazionale a valere sul
“Fondo per la promozione di Accordi Istituzionali"
1/06/2010 - 31/05/2012: Progetto "Optical MEMS-based High Performance Bio Sensor Array".
Accordo Bilaterale CNR-TUBITAK. Altri partner: Koc University, Istanbul.
1/09/2010-31/08/2015 Nanosystems for early Diagnosis of Neurodegenerative Diseases (NADINE) FP7 NMP-2009.
Responsabilità gestionali all’interno del CNR
2005–presente Responsabile della Commessa : “Sviluppo di Microsistemi Analitici”
Istituto di Chimica del Riconoscimento Molecolare, C.N.R. nominata in data 07/11/2005 con lettera non protocollata del Direttore:
Dott. Giacomo Carrea.
2002–presente Membro del Consiglio Scientifico dell' Istituto di Chimica del Riconoscimento Molecolare.
Partecipazione a Commissioni, Commissioni di valutazione (referaggio), Gruppi di Lavoro, od altri Organismi di natura scientifico tecnica
Dal 2018 ad oggi: Membro del Consiglio Scientifico di EvIta, delle Società Italiana delle Vescicole Extracellulari
2015 Scientific Committee of OSA Optical Biosensors Incubator, Washington DC November 8-10 2015
2011 Scientific Committee of “28th International Symposium on Microscale Bioseparation”
Shanghai October 21-25 2012
2011 Scientific Committee of “26th International Symposium on Microscale Bioseparation” San Diego May 1-5 2011
2012: Valutatore esterno di programmi di ricerca presentati alla Comunità Europea, HEALTH-2012-Innovation-1
2011: Midterm Reviewer del progetto PEPLASER, SP1.01.00.02
2007: Valutatore esterno di programmi di ricerca presentati alla Comunità Europea: HEALTH- 2007-1.1-4.
Dal 2007 ad oggi: Membro dell’ Analytical Chemistry's News & Features Panel
2002 Membro del Comitato Scientifico “Fifth International Symposium on CE, York 26-28 August 2002:
2003 ad oggi: valutatore di articoli per le seguenti riviste scientifiche: Analytical Chemistry, Electrophoresis, Journal of Chromatography A, Journal of Separation Science, Journal Microfluidics and Nanofluidics, Macromolecules
Attività didattica Professore a contratto di:
Insegnamento di Metodologie Biochimiche (45 ore/anno) Corso di Laurea in Scienze Biologiche-Nuovo Ordinamento Universita’ degli Studi Dell’Insubria
Anni Accademici 1994-5; 1996-7; 1998/99; 2001-2002
Insegnamento di Elettroforesi Capillare, corso integrativo dell’insegnamento di Analisi dei Farmaci Biotecnologici (10 ore/anno)
Corso di Laurea in Biotecnologie Farmaceutiche Anno Accademico 2001/2002
Lezioni seminariali di (2 ore)
2008 e 2009 Corso di “Chimica dei polimeri”, Politecnico di Milano 2008 Dottorato in “Proteomica Clinica”, Università di Verona 2003 e 2004 Dottorato in Bioingegneria, Politecnico Milano Summer schools
-CE-Days 2007-Capillary Electrophoresis Advanced Course, Certosa di Pontignano, Siena 2007 -Capillary Electrophoresis Course, Department of Chemistry. University of York 1995-96-97-98
Recenti lezioni magistrali ad invito a congressi internazionali e nazionali;
Agosto 29-31, 2018, Padova, Biomarkers and Biogenesis of Extracellular Vescicles Workshop.
"Digital Detection of ExosomesCcaptured on a Microarray based Solid Phase Chip by Interferometric Imaging"
April 18-20, 2017, Mosca, The IX All-Russia Scientific and Practical Conference with International partecipation, Molecular Diagnostics 2017, "A New Microarray approach for Ultra-Sensitive Genotyping of KRAS Gene Variants in Colorectal Cancer"
October 21-24, 2012, Shanghai China, 28th International Symposium on MicroScale
Bioseparations and Analyses. "Polymer coatings in micro-system platforms for biosensing" M.
Chiari
February 27 - March 2, 2012, American Physics Society (APS) March Meeting 2012, Boston, MA. "Integration of Materials and Functions in Microfluidic Devices"
Pubblicazioni recenti
1. Chiodi, E., Sola, L., Brambilla, D., Cretich, M., Marn, AM., Unlu, MS., Chiari, M ., Simultaneous evaluation of multiple microarray surface chemistries through real-time interferometric imaging, ANALYTICAL AND BIOANALYTICAL CHEMISTRY, 412, 3477–3487 (2020)
2. Galbiati, S., Damin, F., Ferraro, L., Soriani, N., Burgio, V., Ronzoni, M., Gianni, L., Ferrari, M., Chiari, M., Microarray Approach Combined with ddPCR: An Useful Pipeline for the Detection and Quantification of Circulating Tumour DNA Mutations, CELLS (2019), Volume: 8, Issue: 8, Article Number: 769
3. Sola, L., Damin, F., Chiari, M., Array of multifunctional polymers for localized
immobilization of biomolecules on microarray substrates, ANALYTICA CHIMICA ACTA, 2019, Volume: 1047, Pages: 188-196
4. Daaboul, GG., Gagni, P., Benussi, L., Bettotti, P., Ciani, M., Cretich, M ., Freedman, DS., Ghidoni, R., Ozkumur, AY., Piotto, C., Prosperi, D., Santini, B., Unlu, MS., Chiari, M., Digital Detection of Exosomes by Interferometric Imaging, SCIENTIFIC REPORTS, (2018), Volume: 6 Article Number: 37246
5. Finetti, C., Sola, L., Elliott, J., Chiari, M, Synthesis of hydrogel via click chemistry for DNA electrophoresis, JOURNAL OF CHROMATOGRAPHY A, 2017, 513, 226-234, 6. Gori, A., Cretich, M., Vanna, R., Sola, L., Gagni, P., Bruni, G., Liprino, M., Gramatica, F.,
Burastero, S., Chiari, M., Multiple epitope presentation and surface density control enabled by chemoselective immobilization lead to enhanced performance in IgE-binding
fingerprinting on peptide microarrays, ANALYTICA CHIMICA ACTA, 2017, 983, 189- 197.
7. Damin, F., Galbiati, S., Ferrari, M., Chiari, M, DNA microarray-based solid-phase PCR on copoly (DMA-NAS-MAPS) silicon coated slides: An example of relevant clinical
application, BIOSENSORS & BIOELECTRONICS, 2016, 258, 3750
8. Finetti, C., Plavisch, L., Chiari, M., Use of quantum dots as mass and fluorescence labels in microarray biosensing, TALANTA, 2016, 147, 397-401.
9. Gagni, P., Cretich, M., Benussi, L., Tonoli, E., Ciani, M., Ghidoni, R., Santini, B., Galbiati, E., Prosperi D., Chiari M., Combined mass quantitation and phenotyping of intact
extracellular vesicles by a microarray platform, 2016, ANALYTICA CHIMICA ACTA, 902, 160-167
10. Sola L, Chiari M., Tuning capillary surface properties by charged polymeric coatings, J.
Chrom. A, 2015, 1414, 173-181, impact factor 4,169
Brevetti
1. DOMANDA DI BREVETTO ITALIANO 102019000018239: METODO PER L'ISOLAMENTO DI VESCICOLE EXTRACELLULARI INTATTE
2. PCT/IB2018/052219: GENOTYPING OF MUTATIONS BY COMBINATION OF IN- TUBE HYBRIDIZATION AND UNIVERSAL TAG-MICROARRAY”
3. US20160200847A1: CLICKABLE POLYMERS AND GELS FOR MICROARRAY AND OTHER APPLICATIONS
4. US PATENT 10208225: FLUORO COPOLYMERS, IMMOBILIZATION OF BIOMOLECULES, AND MICROARRAYS
5. US 2006/0141464 AI: METHOD FOR IMMOBILIZING BIOLOGIC MOLECULES ON SOLID SURFACES
6. SILANE COPOLYMERS AND USES THEREOF US APPLICATION NUMBER N°
13/639,605
7. SILANE COPOLYMERS AND USES THEREOF. EUROPEAN REGIONAL PHASE OF PCT/EP2011/055574, FILING NUMBER EP 11 714 266.1.
8. US 6410668, ISSUED 25 JUN 2002: ROBUST POLYMER COATING 9. US 6074542 - ISSUED 13 JUN 2000: COMPOUNDS FOR MOLECULAR
SEPARATIONS
10. US 5785832 ISSUED 28 JUL 1998: COVALENTLY CROSS-LINKED, MIXED-BED AGAROSE-POLYACRYLAMIDE MATRICES FOR ELECTROPHORESIS AND CHROMATOGRAPHY
11. US 5470916 - ISSUED 28 NOV 1995: FORMULATIONS FOR POLYACRYLAMIDE MATRICES IN ELECTROKINETIC AND CHROMATOGRAPHIC METHODOLOGIES
