DICHIARAZIONI SOSTITUTIVE Dl CERTRFICAZIONI
( ait . 46 D.P.R. n. 445/2000)
DICHIARAZIONI SOSTITUTIVE DELL'ATTO DI NOTORIETA'
(art. 47 D.P.R. n. 445/2000)
ALLEGATOB
Il sottoscritto
COGNOME: COZZI
NOME: PAOLO ALESSANDRO NATO A: LEGNANO
IL: 23/05/1981
ATTUALMENTE RESIDENTE A:
INDIRIZZO:
TELEFONO:.
PROV.: MILANO
PROV.:
C.A.P.
Visto il D.P.R. 28 Dicembre 2000, n. 445 concernente "T.U. delle disposizioni legislative e regolamentari in materia di documentazione amministrativa" e successive modifiche ed integrazioni;
Vista la Legge 12 Novembre 2011, n. 183 ed in particolare l'art. 15 concernente le nuove disposizioni in materia di certificati e dichiarazioni sostitutive (*);
Consapevole che, ai sensi dell'art. 76 del DPR 445/2000, le dichiarazioni mendaci, la falsità negli atti e l'uso di atti falsi sono punite ai sensi del Codice penale e delle leggi speciali vigenti in materia, dichiara sotto la propria responsabilità:
che quanto dichiarato nel seguente curriculum vitae et studiorum comprensivo delle informazioni sulla produzione scientifica
corrisponde a verità
Curriculum vitae et studiorum
PERCORSO PROFESSIONALE
• Prestazione Occasionale:
Costmzione di elementi common data p01tal per la gestione del progetto IMAGE-WP5;
collaborazione con i partner per la realizzazione del CDP e degli altri strumenti nece ss ari alla facilitazione dell'import di dati; collaborazione della stesura dei deliverable;
preparazione e partecipazione alle conference call bisettimanali di progetto; attività collaterali di supporto alla prestazione principale
Periodo di attività dal: 01 Novembre 2017 al: 31 Dicembre 2017
Rilasciato da: PARCO TECNOLOGICO PADANO s.r.l., Lodi, 26900 - Via Einstain Loc.
Cascina Codazza
• Contratto di prestazione d'opera ùz regime di collaborazione coordinata e continuativa:
Organizzazione e controllo di dati molecolari (presso il PTP di Lodi) nell'ambito della ricerca GenHome
Periodo di attività dal: OI Agosto 2017 al: 10 Settembre 2017
Rilasciato da: Università Cattolica del Sacro Cuore, sede di Piacenza, via Emilia Parmense
Il. 84
• Assegno di ricerca
Resort tecnologico per la ricerca genomica applicata nelle scienze animali - GenHome Data: 07/02/2014 Protocollo: N. 0000354
Periodo di attività dal: 03 Marzo 2014 al: 30 Giugno 2017
Rilasciato da: Consiglio Nazionale delle Ricerche, C.F. 80054330586, con sede in Roma Piazzale Aldo Moro,7
• Contraffa di collaborazione a progetto:
Sistemi integrati genetici e genomici mirati al rinnovo varietale della filiera risicola italiana
"RISINNOVA"
Periodo di attil'ità dal: 01 Marzo 2012 al: 28 Febbraio 2014
Rilasciato da: FONDAZIONE PARCO TECNOLOGICO PADANO, Lodi, 26900 - Via Einstain Loc. Cascina Codazza
• Contratto di prestazione d'opera in regime di collaborazione coordinata e continuativa:
Costruzione di banche dati di sequenze biologiche e di browser genomici di animali domestici
Data: 10/06/2011 Protocollo: N. 0001343
Periodo di attività dal: 20 Luglio 2011 al: 20 Gennaio 2012
Rilasciato da: Consiglio Nazionale delle Ricerche, C.F. 80054330586, con sede in Roma Piazzale Aldo Moro,7
• Incarico professionale
Analisi bioinformatiche di genoma di piccoli mminanti Periodo di attività dal: 20 Giugno 2011 al: 20 Luglio 2011
Rilasciato da: PARCO TECNOLOGICO PADANO s.r.l., Lodi, 26900 - Via Einstain Loc.
Cascina Codazza
• Incarico professionale
Analisi bioinformatiche di genoma di piccoli ruminanti Periodo di attit1ità dal: l Febbraio 2011 al: 1 Marzo 2011
Rilasciato da: PARCO TECNOLOGICO PADANO s.r.l.. Lodi, 26900 - Via Einstain Loc.
Cascina Codazza
Nerviano, 07/03/2018
2
• Incarico professionale
Analisi bioinformatiche di genoma di piccoli ruminanti
Periodo di attività dal: 27 Novembre 2010 al: 27 Dicembre 2010
Rilasciato da: PARCO TECNOLOGICO PADANO s.r.l., Lodi, 26900 - Via Einstain Loc.
Cascina Codazza
• Dottorato di ricerca con Borsa
Bioinformatica - attività di ricerca sulle Superfici Molecolari, annotazione funzionale, genomica, HPC
Periodo di attività da: Dicembre 2007 a: Ottobre 2010
Rilasciato da: ITB - CNR Via Fratelli Cervi 93, 20090 Segrate (Ml) Italy
• Borsa di ricerca
Bando per l'accesso alle agevolazioni e servizi previsti dalla Sovvenzione Globale INGENIO
Data: 23/04/2007 Protocollo: N. AOOOl 152
Periodo di artività dal: 1 luglio 2007 al: 31 Dicembre 2007
Rilasciato da: Regione Lombardia - Finlombarda S.p.A., Milano 20122 - via Conservatorio 22
PERCORSO FORMATIVO
• Dottorato di ricerca in Medicina Molecolare
Tesi di dottorato: "Protein Surface Similarities Evaluation For Functional Annotation Studies", Ciclo XX:ill, AA 2009/2010
Tutore: Prof.ssa Paola Comi
Correlatore: Dott. Luciano Milanesi
Periodo di attività da: Dicembre 2007 a: Ottobre 2010 Rilasciato da: Università degli Studi di Milano
• Laurea Specialistica in Bioinfonnatica
Tesi di Laurea: "Sviluppo di un databa,;e per la validazione di procedure di correlazione tra funzionalità proteiche e superfici molecolari", AA 2005-2006
Relatore: Prof. Luca De Gioia
Correlatori: Dott. Luciano Milanesi, Dott. Ivan Merelli Valutazione: 110/110 e lode
Periodo di attil'ità dal: 2004 al: 2007
Rilasciato da : Università degli Studi di Milano Bicocca
• Laurea di primo livello in biotecnologie industriali
Tesi di Laurea: "Meccanismi molecolari responsabili della nefropatia diabetica: ruolo di TGFB nel modello delle cellule mesangiali umane", AA 2003-2004
Relatore: Prof.ssa Anna Maria Colangelo
Correlatore: Dott.ssa Francesca Podestà Valutazione: 99/11O
Periodo di atti vità dal: 2000 al: 2004
Rilasciato da: Università degli Studi di Milano Bicocca
• TNNOVAGEN Winter School
Periodo di attività dal: 21 Gennaio 2013 al: l Febbraio 2013 Presso: Università Cattolica del Sacro Cuore di Piacenza
• Biomed Grid Summer School
Periodo di attività dal: 12 Maggio 2008 al: 16 Maggio 2008 Presso: Varenna
• Corso a supporto dello SPTN-OFF d'impresa, finalizzazione della ricerca ad alto contenuto tecnologico. brevettazione (bOJ 9b003-D)
Periodo di attività dal: 15 Novembre 2007 al: 3 Dicembre 2007 Presso: Università degli Studi di Milano - Bicocca
• Corso per la gestione e la valori;.zazione dei risultati della ricerca accademica e industriale (b0/9b002-e)
Periodo di attività dal: 31 Ottobre 2007 al: 8 Novembre 2007 Presso: Università degli Studi di Milano - Bicocca
• Biomed Grid Summer Se/zoo/
Periodo di attività dal: 14 Maggio 2007 al: 19 Maggio 2007 Presso: Varenna
• Tirocinio
Bioinformatica - attività di ricerca sulle Supe1fici Molecolari, annotazione funzionale, genomica, HPC
Periodo di attività da: Gennaio 2006 a: Aprile 2007
Rilasciato da: ITB - CNR Via Fratelli Cervi 93, 20090 Segrate (MI) Italy Certificazioni
• Responsive Web Design, Coursera Course Certificates, License S2DVLBMKQHH4, Jun 2016
• Responsive Website Basics: Code with HTML, CSS, and JavaScript, Coursera Course Certificates, License MHJG2JVGG6YY, May 2016
• Cloud Cornputing Specialization, 92VREZAXFDWH, Mar 2016
Coursera Course Certificates, License
• Cloud Computing Capstone, Coursera Course Ce1tificates, License XHSR9NRXMH, Feb 2016
• Cloud Networking, Coursera Course Ce1tificates, License FULH3SQJ2D, Dee 2015 Nerviano, 07/03/2018
4
• Cloud Computing Applications, Coursera Verified Certificates, License QJQ3QL7VLQ, Oct 2015
• Cloud Computing Concepts: Pa11 2, Coursera Verified Certificates. License 65U9K8G5AG, Apr 2015
• Getting and Cleaning Data, Coursera Verified Certificates, License VVGHA5CX55, Jun 2015
• Cloud Computing Concepts, Coursera Verified Certificates, License B6BCDN67S2, Mar 2015
• R Programming, Coursera Verified Certificates, License Z6B9K8ALWL, Feb 2015
• The Data Scientist's Toolbox, Coursera Verified Certificates, License CAPN392S8M, Dee 2014
PARTECIPAZIONE AD EVENTI DI INTERESSE SCIENTIFICO Seminari, convegni, workshop
• AWS Summit Milano, 14 April 2016
I
MiCo-Milano Congressi• Microsoft AZURE #lnAlimenta, 25 February 2016 -PTP-Science Park, Lodi
• Rat Community Annotation Workshop. Hinxton, England, 4-6 March 2013
• Italian BioR Day, PTP, Lodi, 30 November 2012
• Ottieni il massimo da MySQL, Cinisello Balsamo, Italy, 28 Septemher 2012
• Evolution in the time of Genomics, Venezia, Italy, 7-9 May 2012 - Relatore
• 4th StatSeq Workshop, Verona, 18-19 Aprii 2012
• Molecular Evolution in the Genomic Era, Roma, ltaly, 29 September - 1 October 2011 - Relatore
• Chance and Neccssity in Evolution, Ravello, Italy, 20-22 October 2010
• FOCUS K3D Conference on Semantic 3D Media and Content, Sophia Antipolis, France, 11- 12 February 2010 - Relatore
• CIBB 08 - International Meeting on Computational Intelligence Methods For Bioinformatics and Biostatistic, Vietri sul mare, 3-4 October 2008 - Relatore
PUBBLICAZIONI
Relatore a convegni nazionali ed internazionali:
• P. Cozzi, L. Milanesi and G. Bernardi, "Segrnenting the human genome iota i ochores'' in Proceedings of Evolution in the time of Genomics, Venezia. ltaly. 7-9 May 2012 - Relatore
• P. Cozzi, L. Milanesi and G. Bemardi, "Segmenting the human genome'' in Proceedings of Molecular Evolution in the Genomic Era, Roma. Italy. 29 September - 1 October 2011 - Relatore
• P. Cozzi, F. Viti, I. Merelli and L. Milanesi, "Exploitation of a 3D-oriented ontology for chòosing the representative proteins in protein suifaces comparison.", in Proceedings of
FOCUS K3D Conference on Semantic 3D Media and Content, lNRV\ Sophia Antipolis - Méditerranée, France. 11-12 February 201O - Relatore
• P. Cozzi, I. Merelli, L. Milanesi, A Visualization ToolKit based application for representing macromolecular surfaces., in: Proceedings of Computational Intelligence Methods For Bioinformatics And Biostatistic, Victri sul Mare (Salerno), 3-4 Octoher 2008 - Relatore
Abstract!Poster in atti di convegno
• A. Volante, A. Tondelli, F. Biscarini, F. Desiderio, R. Pen-ini, P.Cozzi, P. Riccardi, G.
Orasen, C. Biselli, A. Vattari. D. Cavalluzzo, S. McCouch, P. Abbruscato, R. Greco, P.
Piffanelli, L. Cattivelli, G. Valè, "GWA studies for rice adaptation to alternate wetting and drying water management system" in Proceedings of the Joint Congress SIBV-SIGA, Milano, Italy - 8/11 September, 2015
• E. Ronchieri, D. Cesini, D. D'Agostino, V. Ciaschini, G. Dalla Torre, P. Cozzi, D.
Salomoni, A. Clematis, L. Milanesi, I. Merelli, "The WNoDeS Cloud virtualization framework: a macromolecular surface analysis application case study'' in Proceedings of 22nd Euromicro International Conference on Parallel, Distributed and network-based Processing (PDP), Turin, Italy, 12-14 Febrnary 2014
• E. Lumini, S. Ghignane, P. Abbruscato, B. Lazzari, P. Cozzi, M. Vallino, E. Lupotto, P.
Piffanelli, P. Bonfante, "Multiple molecular approaches reveal how bacterial and funga!
communìties thrive in the rice rhizosphere" in Proceedings of the lnternational Workshop:
'·Crop Improvement in a Changing Environment: the RISINNOVA Project for sustainable rice production in Italy", Venezia, ltaly -29/30 October 2012
• P. Cozzi, I. Merelli, D. D'Agostino and L. Milanesi, "A para1Iel implementation of Genetic Algorithms for parameters estimation of Molecular Surfaces sinùlarity analysis", in Proceedings of BITS 2010, Bari, Italy. 14-16 Aprii, 2010.
• D. D'Agostino, A. Clematis, I. Merelli, P. Cozzi, L. Milanesi, "A Parallel Algorithm for Molccular Surface Matching Through lmage representation", in Procedings of Parallel, Distributed and Network-Based Processing (PDP), 17-19 Feb. 2010.
• A. Calabria, D. Di Pasquale, G. Trombetti, P. Cozzi, A. Orro, M, Gnocchi, L. Milanesi,
"Genome Wide Linkage analysis and Systems Knowledge: an Integrated Web Framework for Distributed Excecution and Results Annotation", in: Proceedings of Sysbiohealth 2008, Bologna, 24-25 November 2008
• 1. Merelli, P. Cozzi, L. Milanesi, "A reference database for protein surface comparison using grid technology", in: Proceedings of NETTAB, Santa Margherita di Pula, 10-13 July 2006.
Pubblicazioni szt riviste internazionali censite ISI
• A. Volante, F. Desiderio, A. Tondelli, R. Perrini, G. Orasen, C. Biselli, P. Riccardi, A.
Vattari, D. Cavalluzzo, S. Urso, M. Ben Hassen, A. Fricano, P. Piffanelli, P. Cozzi, F.
Nerviano, 07/03/2018
6
Biscarini, G. A. Sacchi, L. Cattivelli, G. Valè, "Genome-wide analysis of japonica rice performance under limited water and permanent flooding conditions", Frontiers in Plant Science, 8, 1862. Oct. 2017. doi: 10.3389/fpls.2017.01862
• N. Nazzicari, F. Biscarini, P. Cozzi, E. C. Brummer, and P. Annicchiarico, "Marker imputalion efficiency for genotyping-by-sequencing data in rice (Oryza sativa) and alfalfa (Medicago sativa)," Mol. Breed., voi. 36, no. 6, pp. 1-16, 2016.
• F. Biscarini, P. Cozzi, L. Casella, P. Riccardi, A. Vattari, G. Orasen, R. Perrinì, G. Tacconi, A. Tondelli, C. Biselli, L. Cattivelli, J. Spindel, S. McCouch, P. Abbruscato, G. Valé, P.
Piffanelli, and R. Greco, "Genome-Wide Association Study for Traits Related to Plant and Grain Morphology, and Root Architecture in Temperate Rice Accessions'', PLoS One, vol.
11, no. 5, p. e0155425, Jan. 2016.
• P. Cozzi, L. Milanesi, and G. Bernardi, "Segmenting the Human Genome into Isochores", Evol. Bioinforma., vol. 11, pp. 253-261, Nov. 2015.
• I. Merelli, P. Cozzi, E. Ronchieri, D. Cesini, and D. D'Agostino, "Porting bioinformalics applications from grid to clomi: a macrornolccular surface ana.lysis application case study'', Int. J. High Perform. Comput. Appl., no. Mi, Jun. 2015.
• E. L. Nicolazzi, A. Caprera, N. Nazzicari, P. Cozzi, F. Strozzi, C. Lawley, A. Pirani, C.
Soans, F. Brew, H. Jo1jani, G. Evans, B. Simpson, G. Tosser-Klopp, R. Brauning, J. L.
Williarns and A. Stella, "SNPchiMp v.3: integrating and standardizing single nucleotide polymorphism data for livestock species", BMC Genomics. 2015 Apr 10;16(1):283. doi:
10.1186/s 12864-015-1497-1
• I. Merelli, A. Calabria, P. Cozzi, F. Viti, E. Mosca and L. Milanesi, "SNPranker 2.0: a gene- centric data mining tool for diseases associated SNP prioritization in GWAS", BMC Bioinformatics 2013, 14(Suppl l):S9 - http://www.biomedcentral.com/147l-2105/l4/S1/S9
• F. Viti, I. Merelli, A. Calabria, P. Cozzi, E. Mosca, R. Alfieri, L. Milanesi, "Ontology-based resources for bioinformatics analysis", International Journal of Metadata, Semantics and Ontologies, 2011, Volume 6 Issue 1, Septernber 2011.
• A. Calabria, D. Di Pasquale, M. Gnocchi, P. Cozzi, A. Orro, G. Trombetti, L. Milanesi,
"Grid Based Genomc Wide Studics on Atrial Flulter'', Journal of Grid Computing, Volume 8 Issue 4, December 2010, 511-527
• Torri F, Ak:elai A, Lupoli S, Sironi M, Amann-Zalcenstein D, Fumagalli M, Dal Fiume C, Ben-Asher E, Kanyas K, Cagliani R, Cozzi P, Trombetti G, Strik Lievers L, Salvi E, Orro A, Beckmann JS, Lancet D, Kohn Y, Milanesi L, Ehsteìn RB, Lerer B, Macciardi F, "Fine mapping of AHll as a schizophrenia susceptibility gene: from association to evolutionary evidence", FASEB J. 2010 Aug;24(8):3066-3082 - doi: 10.1096/fj.09-152611
• I. Merelli, P. Cozzi, D. D'Agostino, A. Clematis, L. Milanesi, "lmage Based Su1face Matching Algorithm Oriented to Structural Biology'', in lEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics, Volume PP, Issue 99, l.
• P. Cozzi, I. Merelli, L. Milanesi, "A Visualization ToolKit based applìcation far representing macromolecular suifaces". in Lecture Notes in Computer Science 2009 Jun 23, Volume 5488/2009, 284-292, doi: 10.1007/978-3-642-02504-4_26.
• P. D'Ursi, F. Chiappori, I. Merelli, P. Cozzi, E. Rovida, L. Milanesi, "Virtual screening pipeline and ligand modelling for H5N I neurarninidase", Biochem Biophys Res Commun.
2009 Jun 12;383(4):445-449.
• D. D'Agostino, A. Clematis, I. Merelli, P. Cozzi and L. Milanesi, "Parallel Decomposition of 3D Surfaces in Images of Locai Descriptors for Molecular Screening", in Parallel, Distributed and Network-based Processing, pp.261-267, 2009.
• I. Merelli. P. Cozzi, D. D'Agostino, A. Clematis and L. Milanesi, "lmages Based System for Surface Matching in Macromolecular Screening", IEEE International Conference on Bioinforrnatics and Biomedicine, pp.397-401, 2008
Pubblicazioni con ISBN
• L. Milanesi, I. Merelli, G. Trombetti,
P.
Cozzi, A. Orro, '·Functional Genomics Applications in Grid", in: Handbook of Research on Computational Grid Technologies for Life Sciences, Biomedicine and Healtcare, Ed. Mario Catannaro. ed. IGI Global, p. 149, 168, DOI: 10.4018/978- 1-60566-374-6, ISBN13: 9781605663746, TSBNJO: 1605663743, EISBN13: 9781605663753Pubblicazioni in fase di sottomiss:.mc/prepara:ione
• F. Biscarini, P. Cozzi, P. Orozoco-ter Wengel, "Lessons leamt on the analysis of large sequence data in anima! genomics"', Animai Genetics, Accepted
FIRMA
(*) ai sensi dell'art. 15, comma 1 della legge 12/12/2011, 11. 183 le certificazioni rilasciate dalla P.A. in ordine a stati, qualità personali e fatti sono valide e utilizzabili solo nei rapporti tra privati; nei rapporti con gli Organo della Pubblica Amministrazione e i gestori di pubblici servizi,
i
certificati so1w sempre sostituiti dalle dichiarazioni sostitutive di certificazione o dall'atto di notorietà di cui agli artt. 46 e 47 del DPR 445/2000Nerviano, 07/03/2019
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