Proteine a motivi tutto b

(1)

Proteine a motivi tutto b

Biotecnologie Industriali-Modulo Processi

(2)

Proteine a motivi tutto b

Superossido dismutasi : un esempio di struttura a forma di botte

(3)

Proteine a motivi tutto b

(4)

Proteine a motivi tutto b

Motivi strutturali a foglietto b adiacenti

possono originare numerose combinazioni

(5)

1) Struttura a botte testa-coda

2) Struttura a botte a chiave greca 3) Struttura a botte jelly-roll

Proteine a motivi tutto b

Le strutture composti da motivi tutto b sono

di tre tipologie differenti :

(6)

1) Struttura a botte testa-coda

2) Struttura a botte a chiave greca

1) Struttura a botte jelly-roll

(7)

Schema generale di una struttura a botte testa- coda nelle proteine contenenti motivi tutto b

(8)

Un esempio di struttura a botte testa-coda:

la proteina legante il retinolo RBP

(9)

Ciclo vitale della proteina legante il retinolo (RBP)

(10)

Beta-carotene, retinale e retinolo

(11)

Acido retinoico, retinale e retinolo

(12)

Ciclo vitale della la proteina legante il retinolo (RBP)

(13)

Un esempio di struttura a botte testa-coda:

la proteina legante il retinolo (RBP)

(14)

Un esempio di struttura a botte testa-coda:

la proteina legante il retinolo (RBP)

Struttura ad alfa-elica

Molecola del retinolo

Sito di entrata

del retinolo

(15)

Un esempio di struttura a botte testa-coda:

la proteina legante il retinolo (RBP)

(16)

Un esempio di struttura a botte testa-coda:

la proteina legante il retinolo (RBP)

(17)

Schema delle interazioni idrofobiche che stabilizzano il ligando nella proteina

legante il retinolo

(18)

Alcuni esempi di proteine appartenenti alla famiglie delle lipocaline

(19)

Un esempio di struttura a botte testa-coda:

la proteina legante gli acidi grassi della famiglia delle P2

(20)

Un esempio di struttura a botte testa-coda:

la proteina legante gli acidi grassi della famiglia delle P2

(21)

Un esempio di struttura a botte testa-coda:

la proteina legante gli acidi grassi della famiglia delle P2

(22)

Un esempio di struttura complessa formata da domini a tutto b: la neuraminidasi

(23)

Un esempio di struttura complessa formata da domini a tutto b: la neuraminidasi

(24)

Un esempio di struttura complessa formata da domini a tutto b: la neuraminidasi

(25)

Un esempio di struttura complessa formata da domini a tutto b:la neuramminidasi

(26)

Un esempio di struttura complessa formata da domini a tutto b: la neuramminidasi

(27)

1) Struttura a botte testa-coda

2) Struttura a botte a chiave greca

1) Struttura a botte jelly-roll

(28)

Proteine a struttura a chiave greca

NH2 COOH

NH2 COOH

(29)

Il ripiegamento di due strutture a forcina b adiacenti determina la formazione del motivo a chiave greca

(30)

Disegno schematico del motivo a chiave greca nella struttura a botte

(31)

Proteine a struttura a chiave greca:

la cristallina g

(32)

Proteine a struttura a chiave greca:

la cristallina g

(33)

Struttura dimerica della cristallina g (170 aa)

(34)

Struttura a doppia chiave greca

nel monomero di cristallina g (83 aa)

(35)

Diagramma di topologia della proteina cristallina g

(36)

NH2 COOH

Diagramma di topologia della proteina cristallina g

2 1 4 7 6 5 8 3

Corso di Biotecnologie Industriali-Modulo Processi

(37)

Diagramma di topologia della proteina cristallina g

(38)

Proteine a struttura a chiave greca:

la cristallina g

(39)

Proteine a struttura a chiave greca:

il gene della cristallina g

(40)

Proteine a struttura a chiave greca:

la cristallina g

(41)

1) Struttura a botte testa-coda

2) Struttura a botte a chiave greca

1) Struttura a botte jelly-roll

(42)

Struttura a botte jelly-roll : cosa ci ricorda ?

(43)

Proteine a struttura a botte jelly roll

NH2 COOH

(44)

Motivo a struttura a botte jelly roll

(45)

Motivo a struttura a botte jelly roll

(46)

Motivo a struttura a botte jelly roll

(47)

L’emoagglutinina, la proteina di rivestimento del capside del virus dell’influenza

(48)

L’emoagglutinina, la proteina di rivestimento

del capside del virus dell’influenza

(49)

Proteina di rivestimento del capside

del virus dell’influenza

(50)

Proteina di rivestimento del capside

del virus dell’influenza

(51)

Proteina di rivestimento del capside

del virus dell’influenza

(52)

Proteina di rivestimento del capside

del virus dell’influenza

(53)

L’emoagglutinina, la proteina di rivestimento

del capside del virus dell’influenza

(54)

Proteina di rivestimento del capside

del virus dell’influenza

(55)

Proteina di rivestimento del capside

del virus dell’influenza

(56)

Proteina di rivestimento del capside

del virus dell’influenza

(57)

Proteine a struttura eliche b a due filamenti

(58)

Proteine a struttura eliche b parallele a tre filamenti

(59)

Proteine a struttura eliche b a tre filamenti

(60)

Proteine a struttura eliche b a tre filamenti

(61)

Proteine a motivi a/b

(62)

Proteine a motivi a/b

Esistono tre classi di proteine a/b :

1) Le proteine a struttura botte TIM (triosofosfatoisomerasi) 2) Le proteine a foglietto aperto (ripiegamento di Rosmann) 3) Le proteine con motivi ricchi di leucina (ripiegamento a

ferro di cavallo)

(63)

Proteine a botte TIM e a foglietto aperto

(64)

Proteine con motivi ricchi di leucina (ripiegamento a ferro di cavallo)

(65)

Proteine a botte TIM e a foglietto aperto

(66)

I motivi a/b sono strutture ad andamento destrorso

(67)

Proteine a botte TIM e a foglietto aperto

(68)

Proteine a botte a/b TIM

(69)

Proteine a botte a/b TIM e il castello di Federico II ad Andria

(70)

Proteine a botte a/b TIM

(71)

Proteine a b foglietto chiuse formate

da filamenti antiparalleli

(72)

Proteine a b foglietto chiuse formate da filamenti paralleli

Aminoacidi polari

Aminoacidi non polari

(73)

Proteine a botte a/b TIM formate da filamenti paralleli

Core idrofobico

(74)

Un esempio di proteina a botte a/b TIM:

metil malonil-coenzima A mutasi

(75)

Un esempio di proteina a botte a/b TIM:

metil malonil-coenzima A mutasi o isomerasi

(76)

Un esempio di proteina a botte a/b TIM:

metil malonil-coenzima A mutasi

Aminoacidi polari

(treonina, serina) nel core idrofobico per costituire

(77)

Un esempio di proteina a botte a/b TIM:

la piruvato chinasi

(78)

Un esempio di proteina a botte a/b TIM:

la piruvato chinasi

1° dominio a filamenti beta antiparalleli

2° dominio a botte a/b

4° dominio a/b a foglietto aperto 3° dominio ad a-elica

(Dimerizzazione)

(Catalisi)

(79)

Un esempio di proteina a botte a/b TIM:

la piruvato chinasi

Sito attivo

(80)

Il sito attivo nelle proteine a struttura a botte a/b è al centro delle regioni loop

(81)

Il sito attivo in una proteina a struttura a

botte a/b : la ribulosio 1,5 bisfosfato carbossilasi

(82)

Proteine con motivi ricchi di leucina (ripiegamento a ferro di cavallo)

(83)

Proteine con motivi ricchi di leucina (ripiegamento a ferro di cavallo)

(84)

Proteine a b foglietto chiuse formate

da filamenti antiparalleli

(85)

Proteine a b foglietto chiuse formate

da filamenti antiparalleli

(86)

Una proteina con motivi ricchi di leucina, l’inibitore

della ribonucleasi

(87)

Una proteina con motivi ricchi di leucina, l’inibitore

della ribonucleasi

(88)

Una proteina con motivi ricchi di leucina, i recettori

Toll-like nella risposta immunitaria

(89)

Il ripiegamento di Rossman è l’unità strutturale delle proteine a foglietto aperto

(90)

Proteine a botte TIM e a foglietto aperto

(91)

I motivi a/b sono strutture ad andamento destrorso

(92)

Proteine a/b a foglietto aperto

(93)

Proteine a/b a foglietto aperto

(94)

Proteine a motivi a+b

(95)

Un esempio di proteina a motivi a+b:

la proteina GFP ( green fluorescent protein)

(96)

Un esempio di proteina a motivi a+b:

la proteina TATA binding protein

(97)