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Indice
Introduzione
ICapitolo 1
1.1 I cromosomi e l’informazione genetica 1
1.2 Primi studi sul DNA 2
1.3 La struttura del DNA 4
1.4 La replicazione del DNA 8
1.5 La ricombinazione del DNA 11
1.6 Geni e proteine 12
1.7 La sintesi delle proteine 14
1.8 Il codice genetico 18
1.9 Mutazioni 20
Riferimenti bibliografici capitolo 1 25
Capitolo 2
2.1 Introduzione al sequenziamento del DNA 28 2.2 Metodologie di estrazione degli acidi nucleici 31
ii
2.3 Tecniche elettroforetiche 36 2.3.1 Principi generali di elettroforesi 38 2.3.2 Materiali di supporto 43 2.3.3 Elettroforesi di DNA su gel di agarosio 45 2.3.4 Pulsed Field Gel Electrophoresis (PFGE) 48 2.3.5 Elettroforesi Capillare (CE) 50 2.4 Tecniche di sequenziamento del DNA 56 2.4.1 Blotting di DNA, RNA e proteine 56 2.4.2 Metodo dei didesossi di Sanger 57 2.4.3 Sequenziamento del DNA per ibridazione con
gruppi di nucleotidi (microarray di DNA) 62 2.5 Funzionamento e applicazioni della PCR 64 Riferimenti bibliografici capitolo 2 69
Capitolo 3
3.1 Introduzione di strumenti microfabbricati per applicazioni
biochimiche 75 3.2 Realizzazione di microarray per analisi di acidi nucleici 78
3.2.1 Microarray di cloni di DNA 79 3.2.2 Microarray di oligonucleotidi prefabbricati 82 3.2.3 Microarray di oligonucleotidi sintetizzati in situ 85 3.3 Sistemi elettroforetici microfabbricati 92
3.3.1 Sequenziamento del DNA usando array
microfabbricati per elettroforesi capillare 93 3.3.2 Strumenti monolitici per elettroforesi capillare
iii
3.4 Progetto di “Lab On Chip” monolitico su silicio in grado di
realizzare amplificazione e analisi di campioni di DNA 117 Riferimenti bibliografici capitolo 3 129
